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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000454`

染色体: Chr04 坐标: 4818630-4819599 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000454`
名称	SmilChr04G000454
描述	protein RETICULATA-RELATED 4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4818630 - 4819599 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022339`
GeneID	`131022339`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022339`
原始查询	`SmilChr04G000454`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RETICULATA-RELATED 4, chloroplastic-like
产物	protein RETICULATA-RELATED 4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G12470` (AT5G12470) UvrABC system C protein, putative (DUF3411) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831122] identity=66.7; qcov=0.41; evalue=3.19e-35; confidence=low
Rice	`Os05g0388600` - identity=69.9; qcov=0.405; evalue=6.38e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022339

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807776.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057807776.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057807776.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807776.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807776.1`

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EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4818857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr4:4818881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:4819040`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A8,B104,B27,B31,B53,B66,B85,B87,B89

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951793.1
TATATAGGAGTGGAGTAGATTTTTCTTAAAATTCCAAATTCGTTTACTCATACTCTGTCTTCTCGAGTCAACCCCTCACCCACTGTTTCCCTATCTCTCTCTCTCTTTCTCTCACACACACAATCAAGAGAGAGAGAGGAGGGACAAACGAGGTCAGCCAGCCACCTCCTAGATGGCCACCGCCGCTTTTTCACGCCTCACAACTCAATTCATCGCCTCACCAAATGCGCACCACCACCACCGCCACCACTCTCCCTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022339
ATGGCCACCGCCGCTTTTTCACGCCTCACAACTCAATTCATCGCCTCACCAAATGCGCACCACCACCACCGCCACCACTCTCCCTCGTCCCTTGCCTATCCGTCGACTACCCAATTCCTTAAAGTTACTCTCTCCTCAACTTCTTCGCTCCAACTAATTGGCTCTCTCCACTCCCCTCGCCGTCCTTCATTTAATCTTATATTGTTCAGCGTCGGCGGAGGCGATGAATCCGGCGGTGGCCTTAGCGGCGGTGGCGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807776.1
MATAAFSRLTTQFIASPNAHHHHRHHSPSSLAYPSTTQFLKVTLSSTSSLQLIGSLHSPRRPSFNLILFSVGGGDESGGGLSGGGGGGGGGGDSGDGDAGKRNKAEAIMALAEAGRSLDSIPKDLAAAIEAGRIPGSIVHRFFELEKSPFLGWLLRFGGFKERLLADDLFLTKVGIECGVGIFTKVCHLFHIMLHLTRMFFNISE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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