当前解析结果
SmilChr04G000456| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000456 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000456 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000456 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 4824923 - 4830398 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022338 |
|---|---|
| GeneID | 131022338 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022338 |
| 原始查询 | SmilChr04G000456 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022338 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807775.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057807775.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.80000 | XP_057807775.1 |
| 4 | PML body | PML body | 0.40000 | XP_057807775.1 |
| 5 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057807775.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:4826109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A19,A20,C15,C54,C55 |
Chr4:4826150 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr4:4826184 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | A4,B111 |
Chr4:4826184 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,B111 |
Chr4:4826213 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C76,D11 |
Chr4:4826213 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | C76,D11 |
Chr4:4826251 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B30,C33 |
Chr4:4826327 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A5,B12,B19,C21 |
Chr4:4826350 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A13 |
Chr4:4826373 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr4:4826374 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B132,B30 |
Chr4:4826391 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B13,B44,C19,C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。