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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000460`

染色体: Chr04 坐标: 4896849-4901416 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000460`
名称	SmilChr04G000460
描述	protein RETICULATA-RELATED 4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4896849 - 4901416 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022343`
GeneID	`131022343`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022343`
原始查询	`SmilChr04G000460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RETICULATA-RELATED 4, chloroplastic-like
产物	protein RETICULATA-RELATED 4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G12470` (AT5G12470) UvrABC system C protein, putative (DUF3411) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831122] identity=72.4; qcov=0.735; evalue=5.44e-158; confidence=high
Rice	`Os05g0388600` - identity=78.8; qcov=0.728; evalue=1.37e-166; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11891 (RETICULATA-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022343

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807781.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057807781.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807781.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807781.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4898254`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	130	A1,A11,A14,A16,A18,A19,A2,A23,A24,A3,A6,A7,B100,B103,B105,B106,B11,B111,B112,B117,B118,B119,B120,B122,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B132,B134,B136,B137,B140,B15,B17,B19,B22,B23,B24,B27,B29,B32,B41,B42,B43,B46,B48,B49,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B62,B64,B65,B67,B69,B7,B70,B71,B75,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B94,B95,B96,C11,C12,C13,C14,C19,C2,C22,C23,C25,C29,C30,C31,C32,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C44,C45,C46,C47,C54,C56,C59,C62,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C74,C78,C79,C8,C81,C85,C9,D10,D11,D3,D7,D9
`Chr4:4900869`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B58,C74
`Chr4:4900869`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B58,C74
`Chr4:4901059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B27,B41,C43
`Chr4:4901075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807781.1

389 aa

194

389

RETICULATA-like

PF11891 RETICULATA-like 162-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807781.1`	Pfam	`PF11891`	RETICULATA-like	Family	162	339	5.9e-66	222.3	Protein RETICULATA-related

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951798.1
ATTAGCATCATCCTTTCCCTCTAATGAAATGGGGTCACTAACATCACAACATATACTATACTGCATTTATAATGTGACTATCTATGTAAGGAAATACTACTATTACTATATAGGAGTGGAGTAGATTTTTCTTAAAATTCCAAATTCGTTTACTCATACTCTTTGTTTTCTGCAGTCAACCCCTCACCCACCGTTTCCCTATCTCTCTCTCTTTCTCTCACACACACAATCAAGAGAGAGAGAGGAGGGACAAACGAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022343
ATGGCCACCGCCGCTTTTTCACGCCTCACAACTCAATTCATCGCCTCACCAAATGCGCACCACCACCACCGCCACCACTCTCCCTCGTCCCTTGCCTATCCGTCGACTACCCAATTCCTTAAAGTTACTCTCTCCTCAACTTCTTCGCTCCAACTAATTGGCTCTCTCCACTCCCCTCGCCGTCCTTCATTTAATCTTATATCGTTCAGCGTCGGCGGAGGCGATGAATCCGGCGGTGGCCTTAGCGGCGGTGGCGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807781.1
MATAAFSRLTTQFIASPNAHHHHRHHSPSSLAYPSTTQFLKVTLSSTSSLQLIGSLHSPRRPSFNLISFSVGGGDESGGGLSGGGGGGGGGGDSGDGDAGKRNKAEAIMALAEAGRSLDSIPKDLAAAIEAGRIPGSIVHRFFELEKSPFLGWLLRFGGFKERLLADDLFLTKVGIECGVGIFTKTAAELEKRRENFTKELDFVLADVVMAIIADFMLVWLPAPTVSLRAPLAVTSGGLSKLFYGCPDNAFQVALAGTSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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