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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000462`

染色体: Chr04 坐标: 4923382-4924398 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000462`
名称	SmilChr04G000462
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4923382 - 4924398 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022885`
GeneID	`131022885`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022885`
原始查询	`SmilChr04G000462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817538]; symbol=AT2G29880; hit=AT2G29880; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817538]; symbol=AT2G29880; hit=AT2G29880; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G29880` (AT2G29880) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817538] identity=35.3; qcov=1.01; evalue=1.43e-50; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3); PF24769 (At2g29880_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022885

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808413.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808413.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808413.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808413.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808413.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4923456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	78	A11,A13,A14,A19,A2,A25,A4,B1,B100,B105,B108,B110,B112,B117,B119,B120,B121,B122,B125,B126,B13,B131,B132,B134,B135,B140,B17,B23,B26,B29,B31,B33,B37,B38,B39,B4,B40,B46,B47,B5,B50,B52,B54,B56,B63,B75,B81,B89,B9,B90,B92,B94,B96,C1,C12,C13,C23,C25,C3,C39,C4,C42,C45,C51,C54,C59,C6,C61,C66,C7,C75,C77,C80,C82,C87,D1,D2,D9
`Chr4:4923490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:4923495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B68
`Chr4:4923514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C6
`Chr4:4923533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,D10
`Chr4:4923620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr4:4923636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,B99,C13
`Chr4:4923645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B43,B79,C60
`Chr4:4923656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C17,C30,C35
`Chr4:4923667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B3,B43,B79,C60
`Chr4:4923675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	148	A1,A10,A11,A14,A16,A18,A19,A23,A24,A3,A4,A6,B100,B104,B105,B106,B108,B11,B110,B111,B112,B115,B117,B118,B119,B120,B122,B123,B125,B126,B129,B13,B130,B132,B134,B136,B137,B14,B140,B15,B17,B19,B22,B23,B24,B27,B29,B32,B34,B35,B39,B41,B43,B44,B46,B47,B48,B49,B51,B52,B53,B55,B56,B58,B59,B6,B62,B64,B65,B67,B69,B7,B70,B71,B75,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B94,B95,B96,C11,C12,C13,C14,C19,C2,C22,C23,C25,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C50,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C62,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C74,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C9,D10,D11,D3,D4,D7,D9
`Chr4:4923680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808413.1

310 aa

155

310

Myb_DNA-bind_3

At2g29880_C

PF12776 Myb_DNA-bind_3 4-101 aa PF24769 At2g29880_C 263-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808413.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	4	101	1.1e-16	62.3	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057808413.1`	Pfam	`PF24769`	At2g29880_C	Domain	263	307	3.9e-15	56.7	At2g29880 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952430.1
ATGTATGAATCATGGACAAAGGAACAAAGTGATGCCTTGTTAGAAATTCTGGTTGAGTCTGCACATAGGGGATGGCACGATAATATTGGTTTATTTAGCAAAGCCACAGTAGAGGAAAGGATATTGCATGTTCTGAATGAAAGACTTAGGTGCAATAAAAATTATAATCACTACCAAAGTCGTATCAAATGGTTTAAGAGCGGTTGGAATGCTTATTCAACACTCTTGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTATGACAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022885
ATGTATGAATCATGGACAAAGGAACAAAGTGATGCCTTGTTAGAAATTCTGGTTGAGTCTGCACATAGGGGATGGCACGATAATATTGGTTTATTTAGCAAAGCCACAGTAGAGGAAAGGATATTGCATGTTCTGAATGAAAGACTTAGGTGCAATAAAAATTATAATCACTACCAAAGTCGTATCAAATGGTTTAAGAGCGGTTGGAATGCTTATTCAACACTCTTGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTATGACAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808413.1
MYESWTKEQSDALLEILVESAHRGWHDNIGLFSKATVEERILHVLNERLRCNKNYNHYQSRIKWFKSGWNAYSTLLKFNSGFGYDNNTKKFTASDEVWDAYVEAHPKDAYLRIGSFSDFEDLGIAVGNGVAVGRNAIGLGSATDARTIGVDESRGPHIEELNYDAENEAFVGLGQDDPPLSGSKSPLAFTEVPVESTQRRAPAKRSRGQFETNSGHTENSSHHEFMAEIKKITSTMDRVESLFVKRDTMLERREKEKSYT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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