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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000464`

染色体: Chr04 坐标: 4953419-4958842 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000464`
名称	SmilChr04G000464
描述	26S rRNA (cytosine-C(5))-methyltransferase NOP2B-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4953419 - 4958842 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022347`
GeneID	`131022347`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022347`
原始查询	`SmilChr04G000464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	26S rRNA (cytosine-C(5))-methyltransferase NOP2B-like
产物	26S rRNA (cytosine-C(5))-methyltransferase NOP2B-like
Arabidopsis	`AT4G26600` (AT4G26600) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828767] identity=59.2; qcov=1.09; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0551300` - identity=64.4; qcov=0.912; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000470 (maturation of LSU-rRNA); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0009383 (rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity); GO:0070475 (rRNA base methylation)
KEGG	-
Pfam	PF01189 (Methyltr_RsmB-F)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022347

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807785.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057807785.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807785.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807785.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807785.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4954645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:4954660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B47,C7
`Chr4:4955180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:4955585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:4956210`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr4:4956210`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr4:4956484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807785.1

616 aa

308

616

Methyltr_RsmB-F

PF01189 Methyltr_RsmB-F 295-505 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807785.1`	Pfam	`PF01189`	Methyltr_RsmB-F	Domain	295	505	6.3e-73	245.4	16S rRNA methyltransferase RsmB/F

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951802.1
CCGCTGTTAAACCCTTCCCCGCCCCTCCCTTATAAAGAAAAACCCCTAATTTCTCTATATTTTCCGGAAACAGCTTTCTTTCACAAATTTCTCCGCCGACCGACGCCGCCGCCGCTGCCGCTTCTGCCGGTCAAATTCATCCTCTTTCTTTCTCATCATTCGACGATTTAATGGCTGGTGCAAAACTCAACAAGAAAAAGGGCGGTAGAGCCGCTAATCCTCCCCCGAGGAAGAAGCAAAAGGCATTACCTACTCTAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022347
ATGGCTGGTGCAAAACTCAACAAGAAAAAGGGCGGTAGAGCCGCTAATCCTCCCCCGAGGAAGAAGCAAAAGGCATTACCTACTCTAGAAAATAAATCTAAGAAAGAGGAGATGATCAGTGACTCTGATGGCTCTGAAGAGCCTGAAATGCTTGAGAACTCAGATGAGGAAGTTCAGGGAATGGACTCGCACTCGGATATGTCGTCAGACGGGGATGATGTCTATGCCAATGATATCCTCCAAGGAAGCGACGATGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807785.1
MAGAKLNKKKGGRAANPPPRKKQKALPTLENKSKKEEMISDSDGSEEPEMLENSDEEVQGMDSHSDMSSDGDDVYANDILQGSDDEEGSDDEEGDSDSDVSDFEKEAREIDEEKAREEVDAEAELELNIKNEANEFALPTEEELEEEAQRPPDLSNLLRRIKEIVRVLSNFKSLRQEGATRKDYVDQLKTDLISYYGYNDFLIEALVEMFPVVELMELIEAFEKPRPICLRTNTLKTRRRDLAGVLLNRGVNLDPLSKWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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