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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000466`

染色体: Chr04 坐标: 4998770-5000404 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000466`
名称	SmilChr04G000466
描述	uncharacterized SmilChr04G000466
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	4998770 - 5000404 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022349`
GeneID	`131022349`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022349`
原始查询	`SmilChr04G000466`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=48.9; qcov=0.326; evalue=2.68e-29; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=51.9; qcov=0.977; evalue=1.21e-143; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022349

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807787.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057807787.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057807787.1`
4	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057807787.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807787.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:4998976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B37
`Chr4:4998983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B15
`Chr4:4998999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B119,C15,C62
`Chr4:4999074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C28
`Chr4:4999079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C85
`Chr4:4999083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:4999087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B89,C14,C86
`Chr4:4999096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr4:4999098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr4:4999134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B89,D7
`Chr4:4999177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C48
`Chr4:4999207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B77,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807787.1

432 aa

216

432

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 59-97 aa PF04827 Plant_tran 166-369 aa PF13359 DDE_Tnp_4 197-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807787.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	59	97	2.7e-20	72.5	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057807787.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	166	369	2.5e-93	312.1	Plant transposon protein
`XP_057807787.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	197	360	6.1e-09	36.4	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951804.1
TTTTTTTTTTTTTTTGCTTTCCAACGGCTCTTTCAACGGCATTCTTCAATTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTTCTTTTCTCTCTATAAATAATACTTCTCCCTACAACTCATTCACCTACAATTCATTCATCACAACTCACTTTCATTCATCACAACTCATTCCTTCTTCCTCCTACAATTTTTCTTCCAAAAATGTCGTCACCTGAACATGATTCTTCGCCCGATTCCGACGAAGTCGCTGAAAAGTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022349
ATGTCGTCACCTGAACATGATTCTTCGCCCGATTCCGACGAAGTCGCTGAAAAGTTCATGGAGTTGGTTGAGTTGCAGAAACAAGTGCTTCAATCATACTACCCCCAACCGGCGCCGGAGCCGGCGCGTGCGAAACGTCCCCGATCATACGTCCACCGTGATCGTGAAGAGGCCCATGTACGTCTTATGCAAGACTACTTCGTCGACAATCCAACGTACGGCCCTACTTTTTTCCGGCGTCGATTTCGCATGCAGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807787.1
MSSPEHDSSPDSDEVAEKFMELVELQKQVLQSYYPQPAPEPARAKRPRSYVHRDREEAHVRLMQDYFVDNPTYGPTFFRRRFRMQKELFLRIVEAVQGEDIYFHMSTDALGRDSLSPLQKCTSAIRQLATGVSADVFDEYLKVADSTGRLCLKKFCKAVIRAFGAHYLRRPTATDVQRLLRMHEARHGFPGMLGSLDCMHWAWKNCPKAWHGAYTRGDQGEPTLILEAVASFDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLNQSPLFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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