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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000473`

染色体: Chr04 坐标: 5042737-5044340 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000473`
名称	SmilChr04G000473
描述	serine/threonine-protein kinase-like protein At3g51990
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5042737 - 5044340 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022353`
GeneID	`131022353`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022353`
原始查询	`SmilChr04G000473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase-like protein At3g51990
产物	serine/threonine-protein kinase-like protein At3g51990
Arabidopsis	`AT3G51990` (AT3G51990) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824362] identity=54; qcov=0.984; evalue=5.49e-124; confidence=high
Rice	`Os05g0387700` (OsRLCK186) - identity=54; qcov=1.02; evalue=4.26e-126; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022353

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057807791.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807791.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807791.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807791.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807791.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5043202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:5043223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B128,C3,C64,C66
`Chr4:5043233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D11
`Chr4:5043321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B77
`Chr4:5043352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr4:5043370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B133,B57,C43
`Chr4:5043394`	`GTC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A10,B138,B57,B67,C5
`Chr4:5043402`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B48
`Chr4:5043402`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B48
`Chr4:5043404`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A10,B57,B67,C5
`Chr4:5043404`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A10,B57,B67,C5
`Chr4:5043409`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807791.1

376 aa

188

376

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 38-303 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 41-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807791.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	38	303	5.1e-37	128.4	Protein kinase domain
`XP_057807791.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	41	307	5e-36	125.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951808.1
AAAGTAAAAAATGGATATTTTTGTGAGATATATTAAAATAATAAAAAGTGTTACTAAAATGGTAAAAGATGGAATGTTTTTGGGGGAGTATTAAATAGAGTGGAGTGGAGTTTAAAAGACAAGAAAAGAAATGCATTAATTGGAAGATGTGTGCAGCAATAATAACCAAATCTTACAACCCAGAGTCAGCTTAGCTGCCAAACCAAATATCGGATTCCATTCTCGTCTCTCTCTTTCTCTCTCTAAATCCATATTCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022353
ATGGGCTACCTCTCCTGCAAAACGGAATCATCCATCTCCACAGCCGATTCCCACCCCATCAAAATCCAAGAATTCAACTACAAAGACCTCCAATTAGCCACCGGCAACTTCTCCGACGCCAAGCTCCTCGGCCGAGGCAGCCACGGCCTCGTCTACAAAGCCGTCCTCCGCGGCGGCCGCCTCGTCGCCGTCAAGAAACCTTCCGCGCCACCCCTCTCCCACAACAATCCTAACGAAGTCGACAACGAAATCGACATCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807791.1
MGYLSCKTESSISTADSHPIKIQEFNYKDLQLATGNFSDAKLLGRGSHGLVYKAVLRGGRLVAVKKPSAPPLSHNNPNEVDNEIDILSSLHSPSLVNLLGFSYNGAAAHGRLLVVEFMSNGTLYDVLHTNPRPPNWGRRLRLALQTARAVETLHSSAPPVIHRDIKSANVLIDRNLNARLGDFGLALRCVDDYRLRSTPPAGTMGYLDPCYVTPDNVSTKTDVFSFGILLLEIISGRKALDMGNSPPSVVDWAIPLIRRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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