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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000478`

染色体: Chr04 坐标: 5098025-5100657 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000478`
名称	SmilChr04G000478
描述	uncharacterized SmilChr04G000478
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5098025 - 5100657 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022889`
GeneID	`131022889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022889`
原始查询	`SmilChr04G000478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=28.3; qcov=0.481; evalue=7.82e-23; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=27.3; qcov=0.48; evalue=1.78e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808416.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808416.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808416.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808416.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808416.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5098044`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A1,A10,A13,A18,A23,A25,A6,A7,B100,B101,B103,B104,B109,B11,B111,B113,B117,B119,B121,B122,B124,B127,B131,B138,B140,B22,B23,B24,B25,B28,B29,B32,B34,B37,B39,B40,B41,B44,B45,B50,B51,B53,B57,B61,B62,B64,B65,B68,B7,B73,B77,B81,B86,B87,B97,C1,C14,C23,C24,C25,C26,C27,C30,C33,C36,C39,C4,C41,C43,C45,C48,C52,C55,C58,C59,C63,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C79,C82,C83,C84,C9,D1,D11,D2,D3,D6
`Chr4:5098048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B25,C27,C45,D10
`Chr4:5098077`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C45
`Chr4:5098077`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C45
`Chr4:5098137`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B137,B3,B74,B93,C55
`Chr4:5098137`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B137,B3,B74,B93,C55
`Chr4:5098150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C27
`Chr4:5098151`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A15,A16,A18,A19,A24,A5,B113,B118,B128,B129,B130,B135,B137,B139,B15,B20,B28,B30,B31,B38,B39,B40,B46,B53,B61,B67,B71,B74,B76,B80,B94,C16,C20,C22,C24,C28,C34,C37,C44,C45,C47,C55,C57,C58,C60,C61,C64,C66,C7,C73,C74,C78,C81,D10,D4
`Chr4:5098153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:5098179`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B3,C55
`Chr4:5098179`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B3,C55
`Chr4:5098182`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B132,B87,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952433.1
ATGGTTTGGACCAGATGGACGGGGGTCCCATTACAAGCGTGGAATCCCAGATTTTTCGAGGCCTTCGGGGCTCGCATGGGAATGGTTCTCAAGATACATGAACTCACAAAATCTAAAGAACGTCTGGACATGGCTTTTATCCAAATTTCCACTGGTCTAGCATCGATCAATAAGGTAATTGAGTGCAAGATTAACGGAGCTCATTTCAAGGTTCGAGTGGAGGAGGTGGACGAGTTTTACATGTCTGGTAAGCTACAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022889
ATGGTTTGGACCAGATGGACGGGGGTCCCATTACAAGCGTGGAATCCCAGATTTTTCGAGGCCTTCGGGGCTCGCATGGGAATGGTTCTCAAGATACATGAACTCACAAAATCTAAAGAACGTCTGGACATGGCTTTTATCCAAATTTCCACTGGTCTAGCATCGATCAATAAGGTAATTGAGTGCAAGATTAACGGAGCTCATTTCAAGGTTCGAGTGGAGGAGGTGGACGAGTTTTACATGTCTGGTAAGCTACAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808416.1
MVWTRWTGVPLQAWNPRFFEAFGARMGMVLKIHELTKSKERLDMAFIQISTGLASINKVIECKINGAHFKVRVEEVDEFYMSGKLQDKDEVVLSEEESFGDEEDEEELSESPAAAQIIGDSILNQSRGVLGPFPTFHANLSCSTQDTAVLPTPEDDYLHAAHEQSWERQFPIQNVQDCNGAGDPSGEFSKRHEVLEEADLVKESLCHDGPTVDNLQISMGRFPNIDIAGPKVVESPCGPEQEREGSSKGGNEQMPEPNSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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