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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000483`

染色体: Chr04 坐标: 5220556-5226183 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000483`
名称	SmilChr04G000483
描述	glycosyltransferase-like KOBITO 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5220556 - 5226183 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022364`
GeneID	`131022364`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022364`
原始查询	`SmilChr04G000483`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase-like KOBITO 1
产物	glycosyltransferase-like KOBITO 1
Arabidopsis	`AT3G08550` (KOB1) elongation defective 1 protein / ELD1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820002] identity=73.4; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0232800` - identity=73.7; qcov=0.798; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009737 (response to abscisic acid); GO:0030244 (cellulose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01697 (Glyco_transf_92)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022364

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057807798.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807798.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807798.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807798.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807798.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5221072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C10
`Chr4:5221110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B26,C5
`Chr4:5221123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B29
`Chr4:5221145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C20
`Chr4:5221213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B62,B9,B97
`Chr4:5221217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr4:5222609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B119,B25,C47,C51
`Chr4:5223796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B111,B72
`Chr4:5223796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B72
`Chr4:5223803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:5223814`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B13,B138,B15,B80,C2,C23
`Chr4:5223815`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B13,B138,B15,B80,C2,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807798.1

520 aa

260

520

Glyco_transf_92

PF01697 Glyco_transf_92 113-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807798.1`	Pfam	`PF01697`	Glyco_transf_92	Domain	113	355	1.6e-05	25.4	Glycosyltransferase family 92

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951815.1
ATGGTAGGTACCTTCGGACAACACATATTTGGCTCATCCTATTCTTCCACTTTCCCCCAATTCATGAGTGCGAATTTTGAAAATCCAACCAAAATTATTATCTGTATAATCTAATTTGCGAAATACTCATAAAATCCAATGTGCCCAATATCTAGCACAATCTAATTACAAATATTTATAACAGCAGTTACAAGAATTAATAAAATAATGAAGAAATTTGGTTTGTTTTAAATGAAAAGAAAATCAAGACTCCACTAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022364
ATGGCGGGTCTCCGGCCGCAACCACCGTCCTCCGCCGCCACCCACCACTCCTTCACCGCCAAACTCCTCCTCCTCCTCACCCTCCTCCCCCTCTCCCTCGCCATCTTCGCCTTCCTCCTCCAATGGCGCGGCGGCGGCATCGATGATCCCATCTCCCGATGGTCGCCCGACGAATCTCACAAGTTTCCCGGCATGGATTCGTCCCCTCTCGCCACCGTCGGTCACTCATCCTCCCATTCTTCCGATTGCACCACGCTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807798.1
MAGLRPQPPSSAATHHSFTAKLLLLLTLLPLSLAIFAFLLQWRGGGIDDPISRWSPDESHKFPGMDSSPLATVGHSSSHSSDCTTLFGHSSTASFPYRDWKFNFHADLKPKICVTTSTSAGLEQILPWMFYHKVIGVSTFFLFVEGKAASPKVSKVLESIADVKVIYRTKELEEQQARSRIWNETWLSSFFYKPCNYELFVKQSLNMEMAIVMARDAGMDWILHLDTDELIHPAGAREYSLRQLLSEVPKNVDMVVFPNY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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