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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000491`

染色体: Chr04 坐标: 5340032-5340947 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000491`
名称	SmilChr04G000491
描述	probable thionin-2.4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5340032 - 5340947 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022372`
GeneID	`131022372`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022372`
原始查询	`SmilChr04G000491`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable thionin-2.4
产物	probable thionin-2.4
Arabidopsis	`AT1G66100` (AT1G66100) Plant thionin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842924] identity=61.2; qcov=1; evalue=1.69e-46; confidence=medium
Rice	`Os06g0514100` (Osthi7) - identity=57.4; qcov=1; evalue=6.9e-44; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00321 (Thionin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022372

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057807808.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807808.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807808.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807808.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5340124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B135,B63,B68,D11
`Chr4:5340169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B125,C41
`Chr4:5340169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C41
`Chr4:5340231`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A15,A25,A3,A5,B104,B113,B114,B37,B59,B62,B89,B9,B93,B94,C13,C21,C36,C65,C72,C83
`Chr4:5340232`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	115	A10,A14,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A3,A6,A7,B1,B100,B101,B103,B104,B106,B109,B110,B112,B119,B120,B125,B126,B129,B13,B131,B136,B139,B15,B17,B18,B19,B2,B23,B25,B26,B27,B30,B34,B36,B38,B39,B45,B52,B53,B54,B56,B60,B61,B64,B66,B67,B69,B7,B70,B72,B80,B81,B82,B83,B85,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B96,C1,C11,C14,C16,C2,C20,C22,C23,C24,C29,C3,C30,C31,C39,C4,C40,C41,C47,C48,C5,C50,C51,C57,C59,C6,C67,C69,C7,C70,C73,C75,C76,C79,C8,C80,C81,C84,C85,C86,C9,D11,D2,D4,D5,D7
`Chr4:5340233`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A15,A25,A3,A5,B104,B113,B114,B37,B59,B62,B89,B9,B93,B94,C13,C21,C36,C65,C72,C83
`Chr4:5340234`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	115	A10,A14,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A3,A6,A7,B1,B100,B101,B103,B104,B106,B109,B110,B112,B119,B120,B125,B126,B129,B13,B131,B136,B139,B15,B17,B18,B19,B2,B23,B25,B26,B27,B30,B34,B36,B38,B39,B45,B52,B53,B54,B56,B60,B61,B64,B66,B67,B69,B7,B70,B72,B80,B81,B82,B83,B85,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B96,C1,C11,C14,C16,C2,C20,C22,C23,C24,C29,C3,C30,C31,C39,C4,C40,C41,C47,C48,C5,C50,C51,C57,C59,C6,C67,C69,C7,C70,C73,C75,C76,C79,C8,C80,C81,C84,C85,C86,C9,D11,D2,D4,D5,D7
`Chr4:5340493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B112
`Chr4:5340493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr4:5340615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:5340641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,C8,C80,C86,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807808.1

129 aa

129

Thionin

PF00321 Thionin 26-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807808.1`	Pfam	`PF00321`	Thionin	Domain	26	70	1.1e-18	68.2	Plant thionin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951825.1
CTGGTTTCATCAATACAACTCCAACTCTATATTATATATCAAGAGACAACAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATCGATGGAAGGTAAAAGTAGTCTTATTGCGAGTGCTCTTTTGCTAAGCCTTGTTTTGGGACAAATTCAAGTTGAGGCAAAGAGTTGTTGCCCAAGCACCACTGCCAGAAATATCTATAATGCCTGTCGCTTAGCGGCTGGCTCCAGGCAAATGTGTGCATCACTTAGTGGATGCAAAATCATTGATGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022372
ATGGAAGGTAAAAGTAGTCTTATTGCGAGTGCTCTTTTGCTAAGCCTTGTTTTGGGACAAATTCAAGTTGAGGCAAAGAGTTGTTGCCCAAGCACCACTGCCAGAAATATCTATAATGCCTGTCGCTTAGCGGCTGGCTCCAGGCAAATGTGTGCATCACTTAGTGGATGCAAAATCATTGATGGGACATGTCCCACTGGTTGGACTAATGATATTCTCGAAAACACTGGTGTCGATGAATACTGCAAGTTGGGGTGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807808.1
MEGKSSLIASALLLSLVLGQIQVEAKSCCPSTTARNIYNACRLAAGSRQMCASLSGCKIIDGTCPTGWTNDILENTGVDEYCKLGCASSVCAAISTLQNSDASDAVNGAVEKCTQACSAFCTKASVETA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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