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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000546`

染色体: Chr04 坐标: 6077172-6078440 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000546`
名称	SmilChr04G000546
描述	uncharacterized SmilChr04G000546
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6077172 - 6078440 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022901`
GeneID	`131022901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022901`
原始查询	`SmilChr04G000546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=34.9; qcov=0.845; evalue=3.78e-52; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=41.2; qcov=1.05; evalue=2.07e-98; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808427.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057808427.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057808427.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808427.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808427.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6077222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A11,D8
`Chr4:6077222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,D8
`Chr4:6077243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A2,A22,A8,B107,B122,B127,B134,B135,B22,B29,B37,B4,B40,B47,B54,B73,C12,C21,C25,C27,C36,C58,C78,D1,D4
`Chr4:6077261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	53	A18,A20,A7,A9,B1,B102,B107,B109,B111,B113,B114,B117,B12,B134,B140,B16,B19,B35,B37,B4,B46,B55,B6,B75,B77,B8,B86,B88,B95,B99,C19,C26,C30,C36,C39,C5,C52,C53,C54,C64,C66,C67,C72,C73,C75,C83,C84,C87,D3,D4,D6,D7,D8
`Chr4:6077283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:6077284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:6077323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B132,B5,B91
`Chr4:6077349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A3,B137,B69,C41
`Chr4:6077349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B137,B69,C41
`Chr4:6077357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:6077388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C41
`Chr4:6077403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808427.1

400 aa

200

400

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 57-94 aa PF04827 Plant_tran 198-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808427.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	57	94	5.1e-15	55.7	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057808427.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	198	338	2.1e-58	198.1	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952444.1
ATGGAATGTTTCGATGATAATTCGTCGTCTTCCTCCGACGAGGTAGCGCAGGCGATCATCAATGAGATCCAGGAGCAGGAACAATTGCTTGCTGAAATGTACTACCAACCGGCGCCGAAACGTGTTGTTCATCACCGACAATACGTCCACCGTGATCGTGAGGCTGTCCATTTATGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCGACGCACGGGCTTACATTTTTCCGACGTTGTTTTCGGATGCAGAAGGAGTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022901
ATGGAATGTTTCGATGATAATTCGTCGTCTTCCTCCGACGAGGTAGCGCAGGCGATCATCAATGAGATCCAGGAGCAGGAACAATTGCTTGCTGAAATGTACTACCAACCGGCGCCGAAACGTGTTGTTCATCACCGACAATACGTCCACCGTGATCGTGAGGCTGTCCATTTATGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCGACGCACGGGCTTACATTTTTCCGACGTTGTTTTCGGATGCAGAAGGAGTTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808427.1
MECFDDNSSSSSDEVAQAIINEIQEQEQLLAEMYYQPAPKRVVHHRQYVHRDREAVHLCLMQDYFNDNPTHGLTFFRRCFRMQKELFLRIIETIQGEDTYFQISHDAQGRDSLTPLQKYTAAFSQLATDVNADTFNEYLKVADTTGRLYLKRFCKAVIRAFRAEYLRRPTQADIQRLLQMHEARHGFFGMLGSLDWEPTLILEAVAFHDLWIWHAFFDVAGSNNGINFLNQLPLFSDVLDGTAAPVVFEANRRYYQMGYY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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