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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000552`

染色体: Chr04 坐标: 6171414-6172768 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000552`
名称	SmilChr04G000552
描述	protein spotted leaf 11
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6171414 - 6172768 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022435`
GeneID	`131022435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022435`
原始查询	`SmilChr04G000552`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein spotted leaf 11
产物	protein spotted leaf 11
Arabidopsis	`AT1G08315` (AT1G08315) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837352] identity=58.1; qcov=1; evalue=5.93e-113; confidence=high
Rice	`Os01g0956075` - identity=45.8; qcov=0.993; evalue=6.39e-66; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057807904.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057807904.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807904.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807904.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6171705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B88
`Chr4:6171867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:6172027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B28,B60,C20
`Chr4:6172431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B35,B90,B92,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807904.1

301 aa

150

301

ARM_PUB

PF25598 ARM_PUB 9-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807904.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	9	295	1.3e-15	58.3	Plant U-box protein ARM repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951921.1
AATTTATGCTACCTTTTTCCATTGAGTTTAATTATCAATATTCCACACGAAACTCGAATGAGTATTTACCAAATAAAGAATTATAGTAGTAGTAGTTGAAATATTTCAATGTTGAATTGAAGCAAAAGCAATGAAGAAAAATAGACACCAACTTGGACGAAAAATAAAACAAAAAAACAGATGAAAAGTTCAAGCACTGCTAAAAGTCAGCTTATATACACCCAATCCAACCAAACCCCATCAATTCACAAACAGAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022435
ATGGACGCCGTGAAGCGGAGAACCGTGAAAACCCTAGTCGCGAAGCTCACCTCCGTCTCGGAGCACACCCGCACGGAGGCCATCTGCGAGCTCCGCCTCCTGTCGAAGAACGACGCCGACAGCCGCCCCCTCATCGCCGACGCCGACGCCGTGCCGCTGATCGCCGAGTCGCTCTACTCCCCCGCCGTGATCCTCCAGGAGAACGCCGCCGCGGCGCTGCTCAACCTCTCGATCTCCTCCAAGGAGCACCTGATCTCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807904.1
MDAVKRRTVKTLVAKLTSVSEHTRTEAICELRLLSKNDADSRPLIADADAVPLIAESLYSPAVILQENAAAALLNLSISSKEHLISSRGVLDALSHALRHPAAPSVAQCAAATIFSLLSVESFRPIIGHKRDIIFGLVEIVRGQGSAARSIKDALRALFGVALYPLNRAQMVELGAVQALFSLVVKDGRVGLVEDATAVIAQVAGCEESWEVFRKVLGVEMLMDLLDNATGSSYRTKENAVAALLNLVQCGGEEVASDVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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