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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000576`

染色体: Chr04 坐标: 6421260-6422212 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000576`
名称	SmilChr04G000576
描述	uncharacterized SmilChr04G000576
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6421260 - 6422212 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022459`
GeneID	`131022459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022459`
原始查询	`SmilChr04G000576`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807929.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807929.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807929.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807929.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807929.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6421359`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B111,B49,C11,C45,C62
`Chr4:6421359`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B111,B49,C11,C45,C62
`Chr4:6421372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B35
`Chr4:6421538`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A11,A14,B120,B122,B126,B140,B20,B36,B47,B63,B71,B72,B81,B83,C34,C57,C58,C59,C77,D8
`Chr4:6421541`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A11,A14,B120,B122,B126,B140,B20,B36,B47,B63,B71,B72,B81,B83,C34,C57,C58,C59,C77,D8
`Chr4:6421545`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A11,A14,B120,B122,B126,B140,B20,B36,B41,B47,B63,B71,B72,B81,B83,C34,C57,C58,C59,C77,D8
`Chr4:6421603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr4:6421616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C82
`Chr4:6421622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C56
`Chr4:6421685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	83	A1,A11,A14,A15,A21,A22,A9,B1,B103,B104,B11,B115,B118,B119,B120,B122,B125,B130,B132,B134,B139,B140,B20,B22,B30,B32,B34,B36,B37,B40,B47,B48,B49,B50,B52,B54,B56,B62,B63,B65,B67,B7,B71,B72,B77,B79,B81,B83,B89,B90,B93,B96,C1,C15,C16,C19,C2,C21,C22,C25,C31,C32,C34,C39,C42,C48,C50,C56,C58,C59,C60,C61,C73,C74,C77,C78,C80,C86,D1,D10,D11,D6,D8
`Chr4:6421690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr4:6421851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,A3,B104,C49,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807929.1

164 aa

164

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 23-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807929.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	23	116	4.9e-11	44.1	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951946.1
AGCTTATAATGCTTTCTCGTGAACCTTTATCCACCCCTAATATTATCTATATGTAACCATTATCATGTCAATGTATGAAATCTGTGAACCCAAAAATCTTCCCCAAAAAAATGTCTACCTTTACTTTGTATGATAATGTATGGTCAGAAGCAATGGAAGCAAAGCTAATGGAATTAATCATTTCCGAAAGCGATTCAAAGGGTAACCCAAAAGGACTTCCTAAGTCATATGACTTCCTTGTAAAAGTGCAAGAAACGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022459
ATGAAATCTGTGAACCCAAAAATCTTCCCCAAAAAAATGTCTACCTTTACTTTGTATGATAATGTATGGTCAGAAGCAATGGAAGCAAAGCTAATGGAATTAATCATTTCCGAAAGCGATTCAAAGGGTAACCCAAAAGGACTTCCTAAGTCATATGACTTCCTTGTAAAAGTGCAAGAAACGCTTAATGCACAATTCAACATGAAAGAAGGTGTATATTTCTATATTTCGAAAATCGATTATCTTCAAACCATGTATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807929.1
MKSVNPKIFPKKMSTFTLYDNVWSEAMEAKLMELIISESDSKGNPKGLPKSYDFLVKVQETLNAQFNMKEGVYFYISKIDYLQTMYQAWVSLLHEHGVFWDDLSNTVRASDETWRRIQETNSTQMFYRERGEPHYVALAKLFQEEVFKYLDYDESEPESESNSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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