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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000577`

染色体: Chr04 坐标: 6426831-6429688 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000577`
名称	SmilChr04G000577
描述	uncharacterized SmilChr04G000577
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6426831 - 6429688 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022905`
GeneID	`131022905`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022905`
原始查询	`SmilChr04G000577`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G07190` (AT2G07190) transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288] identity=27; qcov=0.155; evalue=2.74e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022905

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808431.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808431.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808431.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808431.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6426832`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A3,D5
`Chr4:6426832`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A3,D5
`Chr4:6426843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C86
`Chr4:6426877`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A11,A3,B115,B20,B55,B76,B79,B93,C16,C34,C51,C52,C60,C61,C78,D5
`Chr4:6426883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B91
`Chr4:6426896`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C65,C82
`Chr4:6426896`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C65,C82
`Chr4:6426902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,D3
`Chr4:6426910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:6426914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B7,B96
`Chr4:6426929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A13,A23,A7,A8,B101,B106,B107,B114,B130,B136,B14,B16,B17,B2,B26,B27,B33,B35,B38,B39,B44,B56,B69,B76,B77,B84,C1,C13,C18,C20,C23,C24,C27,C32,C34,C35,C37,C4,C55,C57,C6,C62,C66,C68,C73,C78,C8,C81,C85,D11,D7,D9
`Chr4:6426959`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A16,A7,A8,B101,B111,B114,B130,B135,B136,B14,B16,B2,B25,B26,B27,B33,B35,B38,B39,B67,B76,B77,B79,C1,C18,C20,C27,C32,C35,C37,C4,C6,C60,C62,C66,C68,C73,C78,C8,C85,D11,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808431.1

740 aa

370

740

DUF1985

Peptidase_C48

PF09331 DUF1985 8-125 aa PF02902 Peptidase_C48 617-737 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808431.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	8	125	2.4e-13	51.0	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057808431.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	617	737	8.4e-11	42.8	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952448.1
ATGGATCAAAGACTGCTACGTATTTCTGTGTGTGGTAAAGAATTGGAACTAGGGCCACCTGAGTTTCATGTGTTAACTGGTCTCTCGTTTAATGGGTGGGAGCAACCTCCAAGCACTTCACTTTTCTTTAAAAAACATTTCCAAGGGGTGAAAAAAATAACATTCAGCCAACTTAGAGAAGCCTTTCAGAAGCATTGTACTAAATTGGGTGGGGTTGATGATGATGCTTTGAGGTTTGCTTTGTTGATAATTTTGTATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022905
ATGGATCAAAGACTGCTACGTATTTCTGTGTGTGGTAAAGAATTGGAACTAGGGCCACCTGAGTTTCATGTGTTAACTGGTCTCTCGTTTAATGGGTGGGAGCAACCTCCAAGCACTTCACTTTTCTTTAAAAAACATTTCCAAGGGGTGAAAAAAATAACATTCAGCCAACTTAGAGAAGCCTTTCAGAAGCATTGTACTAAATTGGGTGGGGTTGATGATGATGCTTTGAGGTTTGCTTTGTTGATAATTTTGTATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808431.1
MDQRLLRISVCGKELELGPPEFHVLTGLSFNGWEQPPSTSLFFKKHFQGVKKITFSQLREAFQKHCTKLGGVDDDALRFALLIILYGVLWIKHSAARVEESYMHLVDDLERFDKFPWGLVAYEFLVLVSHNNRIKLNLQKKNKKGVTVEIQGFGYALQLFAYEMHNKIGGLCATRLDEAITPRMLRWAPVPHKVGRQKIQALLKPTFASDLNSMQLLPGELENLQAAGIAKGVECRVPLNEIIHFTKKTQPLHTLKKHQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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