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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000579`

染色体: Chr04 坐标: 6441485-6443512 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000579`
名称	SmilChr04G000579
描述	uncharacterized SmilChr04G000579
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6441485 - 6443512 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022906`
GeneID	`131022906`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022906`
原始查询	`SmilChr04G000579`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G07190` (AT2G07190) transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288] identity=28.1; qcov=0.227; evalue=1.28e-10; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808432.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808432.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808432.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808432.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808432.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6441495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C43
`Chr4:6441502`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A3,C66
`Chr4:6441502`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A3,C66
`Chr4:6441503`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A14,A19,B107,B110,B111,B121,B122,B132,B134,B16,B26,B29,B4,B40,B5,C10,C12,C18,C25,C3,C31,C42,C7,D1,D4
`Chr4:6441507`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A9,B108,C14,C26,C45,C49,D9
`Chr4:6441511`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A9,B108,B125,C14,C26,C38,C45,C49,D9
`Chr4:6441512`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B136,C68
`Chr4:6441512`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B136,C68
`Chr4:6441532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B35
`Chr4:6441537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B135,B3,C19
`Chr4:6441547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A10,A13,B1,B102,B104,B114,B125,B126,B136,B25,B29,B38,B39,B42,B44,B53,B61,B66,B73,B8,B81,B87,B91,C15,C37,C42,C45,C49,C63,C68,C73,C77,D3
`Chr4:6441567`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808432.1

564 aa

282

564

DUF1985

PF09331 DUF1985 20-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808432.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	20	103	2.5e-09	38.0	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952449.1
CAGAGTGCTTCGTTGAAAAAGTCTGTACTACAGTATAGAGTTGGAAACCATTTTGTAGAATTTGGGCTGGCTGATTTTGCCATAATGACGGGACTGAAGTTCGGTGGTAGTATCATTTTACCTCAAGGTTCTTTTTTCCACCAAAAAGTTTTTGGTGGACAACGTTATCTGCGTTTGGTAAACATAGAGAAAACCTTTATCAAAGAATGCAAAGAGACCTGTGGCAGATCAGAGACAAGCTTGAAGCTAGCCTATTTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022906
ATGACGGGACTGAAGTTCGGTGGTAGTATCATTTTACCTCAAGGTTCTTTTTTCCACCAAAAAGTTTTTGGTGGACAACGTTATCTGCGTTTGGTAAACATAGAGAAAACCTTTATCAAAGAATGCAAAGAGACCTGTGGCAGATCAGAGACAAGCTTGAAGCTAGCCTATTTGTATATTGTGTACGGGCTTTTGGTGATGAAGGATAGGACGCAGAAGAACGTCGATCTTGGTTATATTCATCTCATGGATGACCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808432.1
MTGLKFGGSIILPQGSFFHQKVFGGQRYLRLVNIEKTFIKECKETCGRSETSLKLAYLYIVYGLLVMKDRTQKNVDLGYIHLMDDLERFLRYPWGRTAYDFLVPRTYNARKLLDKMGTTENRLTVEAYGFVYALQAWAYEIMPSLAAFCGKRLMEHENNIPRMQHWSADSGFHFDDLWPYFLPRSGRDPVPIIVSPTEYKLMDVLGIPSTLHPASPIPVFNAKSLVRKRRLTFEEDEAVGKEAAIQNTPMKNSEHLSLDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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