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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000582`

染色体: Chr04 坐标: 6466383-6470069 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000582`
名称	SmilChr04G000582
描述	uncharacterized SmilChr04G000582
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6466383 - 6470069 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022463`
GeneID	`131022463`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022463`
原始查询	`SmilChr04G000582`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0122100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0122100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=35.6; qcov=0.991; evalue=7.84e-38; confidence=medium
Rice	`Os09g0122100` - identity=44; qcov=1; evalue=9.49e-57; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022463

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807933.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057807933.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807933.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807933.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6467765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A16,B140,C13
`Chr4:6467784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr4:6467800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:6467849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:6467890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B41,B66,C79
`Chr4:6467901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:6468039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B33,B47,C17,C61
`Chr4:6468071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B47,C37
`Chr4:6468103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:6468108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A1,A13,A18,A25,B46,B52,B8,C10,C37
`Chr4:6468142`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B104,B118,B12,B130,B16,B54,B67,B70,C11,C40,C43,C45,C69,C9
`Chr4:6468156`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B54,B76,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807933.1

218 aa

109

218

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

PF13359 DDE_Tnp_4 70-211 aa PF01609 DDE_Tnp_1 84-211 aa

XP_057807934.1

218 aa

109

218

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

PF13359 DDE_Tnp_4 70-211 aa PF01609 DDE_Tnp_1 84-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807933.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	70	211	1.3e-19	71.1	DDE superfamily endonuclease
`XP_057807933.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	84	211	3.2e-05	24.5	Transposase DDE domain
`XP_057807934.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	70	211	1.3e-19	71.1	DDE superfamily endonuclease
`XP_057807934.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	84	211	3.2e-05	24.5	Transposase DDE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101301.1
TCTACGAATTGAAGATTTCAAGGGCATGTTTGTTGGACTGTATAATGGCAATATTGATTAATAACCCGATGTAATCTGTATGTTTGGTGCCTTGGGTATGCTTCTCACGAAGCCCAGGAAAAGGGCTTGGCTCGGTCAAATATCACTATTCAATCAGGCTTACCCAGCCGCCCACTCCCCTCCAATACAGTTTCCAGCCTGCATCGAAATTTGAAAACTTTCTAAATTTCCCTTCGTTCTTTCCATTCAAAATTCTCCTT...

XM_057951950.1
CTACGAATTGAAGATTTCAAGGGCATGTTTGTTGGACTGTATAATGGCAATATTGATTAATAACCCGATGTAATCTGTATGTTTGGTGCCTTGGGTATGCTTCTCACGAAGCCCAGGAAAAGGGCTTGGCTCGGTCAAATATCACTATTCAATCAGGCTTACCCAGCCGCCCACTCCCCTCCAATACAGTTTCCAGCCTGCATCGAAATTTGAAAACTTTCTAAATTTCCCTTCGTTCTTTCCATTCAAAATTCTCCTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022463
ATGTTTCTCTCGGTTCTAGCCCACCACAAAAAGAATAGAGTAGTAGGCTTTGATTTTTGGCGGTCAGGACAAACAATATCACATTACGTGCACGCGGTATTGGGTGCTGTTCTGCGTTTACACGAGACATTTTTAGCAAAACCCGAAGCTGTTAGAGATGATTGCACAGACGCAAGGTGGCAATGGTTCAAGGGTTTTTTAGGAGCTTTGGATGGCACATACGTGAATGTTTTGGTTAGCAATACGGACAAGCCGAGATA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807933.1
MFLSVLAHHKKNRVVGFDFWRSGQTISHYVHAVLGAVLRLHETFLAKPEAVRDDCTDARWQWFKGFLGALDGTYVNVLVSNTDKPRYRTRKCEISTNILAVCDRNLQFVYALSGWESSASDSRILRDALNRPHGLKVPMGNYYLADNGYANCEGFLTPFKGVRYHLKEWGPLAARPQNKEELFNLRHSKARNVIERTFGILKMRWGILRSNTFYPINI

XP_057807934.1
MFLSVLAHHKKNRVVGFDFWRSGQTISHYVHAVLGAVLRLHETFLAKPEAVRDDCTDARWQWFKGFLGALDGTYVNVLVSNTDKPRYRTRKCEISTNILAVCDRNLQFVYALSGWESSASDSRILRDALNRPHGLKVPMGNYYLADNGYANCEGFLTPFKGVRYHLKEWGPLAARPQNKEELFNLRHSKARNVIERTFGILKMRWGILRSNTFYPINI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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