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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000593`

染色体: Chr04 坐标: 6616655-6632838 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000593`
名称	SmilChr04G000593
描述	uncharacterized SmilChr04G000593
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6616655 - 6632838 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022908`
GeneID	`131022908`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022908`
原始查询	`SmilChr04G000593`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=low
产物	OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0581100` (OS-CAD) - identity=28.1; qcov=0.512; evalue=4.35e-09; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022908

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808433.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808433.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808433.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808433.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808433.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6616656`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	112	A1,A11,A13,A15,A16,A18,A20,A21,A23,A25,A3,A6,B10,B101,B104,B108,B111,B112,B113,B118,B119,B122,B124,B126,B127,B130,B132,B135,B136,B137,B15,B16,B17,B18,B2,B25,B27,B30,B33,B34,B35,B37,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B5,B51,B52,B54,B56,B60,B62,B63,B69,B7,B72,B73,B74,B79,B8,B80,B86,B9,B95,B96,B97,B99,C10,C11,C15,C16,C20,C21,C22,C23,C27,C36,C37,C39,C41,C43,C44,C45,C47,C52,C53,C57,C58,C59,C61,C64,C65,C66,C69,C72,C73,C75,C77,C78,C83,C84,C87,D11,D2,D3,D4,D6,D7
`Chr4:6616660`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B101,B2,B27,B56,B96,C43,C77
`Chr4:6616693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:6616700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A11,A15,B119,B124,B132,B42,B43,B5,B79,B9,B97,C10,C42,C44,C45,C57,C58,C64,C66,C69,C72
`Chr4:6616705`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr4:6616705`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr4:6616716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C7
`Chr4:6616722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B59,C42
`Chr4:6616741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B41,B5,C10,C73
`Chr4:6616742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C63,C69
`Chr4:6616786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B138,C42
`Chr4:6631489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952450.1
ATGGGGAGACGAAGAAAGGGGCAGGGGTTGATTTGCATGGCTCTCCAGAATGGGAAGAGAAGAGAGCGATTATCATGCAAACCAAAGGAGGTTGAGGAGAGGATTTTTGAGGAAGAGAAAGAGGCATATGAGGAGAGGTTTTATAGGTACAATATGATTTTTGTGCCTTTTATCGAGAAGGATAACCATGGAAGGTGTGTGATGTTCGGTGCTGGTTTGATATCGCATGAAGATGAAGAATCCTATTCATGGGTTCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022908
ATGGGGAGACGAAGAAAGGGGCAGGGGTTGATTTGCATGGCTCTCCAGAATGGGAAGAGAAGAGAGCGATTATCATGCAAACCAAAGGAGGTTGAGGAGAGGATTTTTGAGGAAGAGAAAGAGGCATATGAGGAGAGGTTTTATAGGTACAATATGATTTTTGTGCCTTTTATCGAGAAGGATAACCATGGAAGGTGTGTGATGTTCGGTGCTGGTTTGATATCGCATGAAGATGAAGAATCCTATTCATGGGTTCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808433.1
MGRRRKGQGLICMALQNGKRRERLSCKPKEVEERIFEEEKEAYEERFYRYNMIFVPFIEKDNHGRCVMFGAGLISHEDEESYSWVLQKDFEMSGLFRTTSMSENEDGFFRRYFNKGSNLVEFFMHFECALEAQRNKFDLLNSADESCFPKLVTELPIERSGVYVVDDGNGHKFNVGYSNLNIKSIPDKYIASHWRKFVDIKKTDSIGGSVVVVDNDIISRPYAKANGCIALVHGDSVRMKELLQAFEVLHDSFIVSTGSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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