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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000596`

染色体: Chr04 坐标: 6670849-6671805 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000596`
名称	SmilChr04G000596
描述	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6670849 - 6671805 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022512`
GeneID	`131022512`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022512`
原始查询	`SmilChr04G000596`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1-like
产物	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1-like
Arabidopsis	`AT4G35800` (NRPB1) RNA polymerase II large subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829734] identity=87.1; qcov=0.758; evalue=7.11e-69; confidence=high
Rice	`Os05g0151000` - identity=86.7; qcov=0.739; evalue=5.22e-66; confidence=high
GO	GO:0001055 (GO:0001055); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04997 (RNA_pol_Rpb1_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022512

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808020.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808020.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808020.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808020.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808020.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6671091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C74
`Chr4:6671094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C82
`Chr4:6671112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C22
`Chr4:6671124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B20
`Chr4:6671287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr4:6671312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B61,B8
`Chr4:6671406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr4:6671482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B20,C8,D7
`Chr4:6671534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:6671558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr4:6671593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808020.1

153 aa

153

RNA_pol_Rpb1_1

PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 14-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808020.1`	Pfam	`PF04997`	RNA_pol_Rpb1_1	Domain	14	116	1.6e-40	140.1	RNA polymerase Rpb1, domain 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952037.1
TCTCCCCCATCTTCTTCATTGGTCTCAAAACCGCCACCTTCTGAGACGAGCGCAGCGCGAAATAAGTTTCTTTCAAATCCCAAAAAATTAATTACTCAACAGAAATCAACAATAATTTGAAGTACTGAAAAACCATAATTTGTTTTTAATTTTGAAATTATTAGTAGCATCATAGATCATAATCAAAAACCTAGGGAACAATTTCCGGTGTCGCAATGGATCTGCGGTTCCCCTTCTCGCCGGCAGAGGTTGCGAAGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022512
ATGGATCTGCGGTTCCCCTTCTCGCCGGCAGAGGTTGCGAAGGTCTGCGTCGTCCAATTCGGCATACTCAGCCCCGATGAGATCAGACAAATGTCAGTTGTGCATATAGAGCACAGCGAGACGACGGAAAGAGGCAAGCCGAAGATCGGTGGTTTGAGCGACCCGCGTCTGGGGACGATTGATCGGAAGATGAAGTGCGAGACTTGTATGGCGAACATGGCTGATTGCCCCGGCCACTTCGGTCACCTTGAGCTCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808020.1
MDLRFPFSPAEVAKVCVVQFGILSPDEIRQMSVVHIEHSETTERGKPKIGGLSDPRLGTIDRKMKCETCMANMADCPGHFGHLELAKPMFHIGFMKTVLSILRSVCFNCSKILADEVLYVSRVFRLKFMDAFGLISMNLYSHLHLIDIGYSLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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