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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000608`

染色体: Chr04 坐标: 6881880-6891867 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000608`
名称	SmilChr04G000608
描述	uncharacterized SmilChr04G000608
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	6881880 - 6891867 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022502`
GeneID	`131022502`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022502`
原始查询	`SmilChr04G000608`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear factor Y, subunit C11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820427]; symbol=NF-YC11; hit=AT3G12480; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nuclear factor Y, subunit C11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820427]; symbol=NF-YC11; hit=AT3G12480; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G12480` (NF-YC11) nuclear factor Y, subunit C11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820427] identity=49.7; qcov=1.06; evalue=9.48e-66; confidence=high
Rice	`Os05g0494100` (DRAP2) - identity=50.4; qcov=1.02; evalue=4.49e-62; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022502

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807999.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807999.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807999.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807999.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:6882183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807999.1

276 aa

138

276

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 8-71 aa

XP_057808000.1

276 aa

138

276

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 8-71 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807999.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	8	71	5.7e-20	72.1	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone
`XP_057808000.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	8	71	5.7e-20	72.1	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952016.1
AGTATAAAAATAAATGGGTATGGTACATGGTGCTGCATCGGTTGTACCCCCCAAATCGTCAAATGCATAACGCAATTTCCCCACGCACTCACTCACAAAATATTACTAATAATTATTATGGTAATAAAAAATTCTGACGTCTTTGGCTTTTTTTCTTCCGAATCCACCATTGTACGGACTCGTCGAGGAAGAATTCGCTAATTCTGCTGCAGTATCTGAGTTTCGGATCTGAATCCAAAATCCATCTATATTCTCAGTTG...

XM_057952017.1
CAATTTCCCCACGCACTCACTCACAAAATATTACTAATAATTATTATGGTAATAAAAAATTCTGACGTCTTTGGCTTTTTTTCTTCCGAATCCACCATTGTACGGACTCGTCGAGGAAGAATTCGCTAATTCTGCTGCAGTATCTGAGTTTCGGATCTGAATCCAAAAGTCTGTTTCTCACTCCTTTTCATCTCTTGCAATCATTTGATCAATCATTTTTCTATTTTTCTTGTCATATTTCTTCCCCTTCTTTGAATTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022502
ATGAAGAAGAAGCTCGATACCCGTTTTCCCGCTGCCCGAATTAAAAAGATCATGCAAGCTGATGAGGATGTCGGGAAGATTGCTATGGCAGTTCCTGTTTTAGTCTCTAAAGCTTTGGAATTGTTTCTCCAAGATCTTTGTGACCGTACATATGACATAACTGTGCAAAGAGGAGCTAAGACTGTTAGTTCATTGCATCTCAAACATTGTGTACATAGTTATAATGTGTTTGACTTTCTCAAGGAAGTAGTCAGTAAAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807999.1
MKKKLDTRFPAARIKKIMQADEDVGKIAMAVPVLVSKALELFLQDLCDRTYDITVQRGAKTVSSLHLKHCVHSYNVFDFLKEVVSKVPDYGHSDSAADVSKRRRVVASESNDDEESKRNIMPETCQASSSGRGRGRGRGRGRGRGRAAERDLPRLEVETGGPTSTPQSVKQVPSPGRPMEDGSELKESPKELKVNDGVSSNSRNFDLNSGVVTDDNSEKPASAAAAASTSTGPTPDVKSEEYPGLSEMDRMVIDPVHLAQ...

XP_057808000.1
MKKKLDTRFPAARIKKIMQADEDVGKIAMAVPVLVSKALELFLQDLCDRTYDITVQRGAKTVSSLHLKHCVHSYNVFDFLKEVVSKVPDYGHSDSAADVSKRRRVVASESNDDEESKRNIMPETCQASSSGRGRGRGRGRGRGRGRAAERDLPRLEVETGGPTSTPQSVKQVPSPGRPMEDGSELKESPKELKVNDGVSSNSRNFDLNSGVVTDDNSEKPASAAAAASTSTGPTPDVKSEEYPGLSEMDRMVIDPVHLAQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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