当前解析结果
SmilChr04G000621| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000621 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000621 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000621 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 7037654 - 7038049 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022915 |
|---|---|
| GeneID | 131022915 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022915 |
| 原始查询 | SmilChr04G000621 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820084]; symbol=AT3G09280; hit=AT3G09280; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820084]; symbol=AT3G09280; hit=AT3G09280; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G09280 (AT3G09280)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820084] identity=36.8; qcov=0.87; evalue=3.23e-15; confidence=low |
| Rice | Os07g0549100 (P0534A03.120)- identity=41.7; qcov=0.458; evalue=1.03e-06; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022915 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057808440.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808440.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808440.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808440.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808440.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:7037768 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr4:7037803 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A14,B1,B109,B126,B65,C50,C70,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。