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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000624`

染色体: Chr04 坐标: 7089487-7092633 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000624`
名称	SmilChr04G000624
描述	probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 48
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7089487 - 7092633 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022496`
GeneID	`131022496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022496`
原始查询	`SmilChr04G000624`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 48
产物	probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 48
Arabidopsis	`AT2G37920` (emb1513) copper ion transmembrane transporter [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818368] identity=71.8; qcov=0.521; evalue=3.58e-79; confidence=medium
Rice	`Os02g0564300` - identity=64; qcov=0.489; evalue=6.9e-58; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807988.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807988.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807988.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807988.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7089777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:7089889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:7089979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr4:7090165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:7090240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:7090298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr4:7090307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:7090389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7090454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B52,B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952007.1
GGCTGTAACGAGTAAAATGGGGCTATGAATAGAATTACTACCAAATTCAAATCCCAATTCACCCAAAACCAGTAGATTTTCTCGAATCCTTTTCTCATCGTCTATTCATCGTCTCTCTCTCTCACACACTCAGAGCTCCCTCGACATTTTTGCACAACAATTTGCACCGTGCATATAAACTAGCATGTCAATCTTGCCATTGTCTCTCTCAGTTCCGGCAACGCCGCAATCTCTCTCATCAGGAAAAGCCCTTTCCGGCG...

XM_057952008.1
GGCTGTAACGAGTAAAATGGGGCTATGAATAGAATTACTACCAAATTCAAATCCCAATTCACCCAAAACCAGTAGATTTTCTCGAATCCTTTTCTCATCGTCTATTCATCGTCTCTCTCTCTCACACACTCAGAGCTCCCTCGACATTTTTGCACAACAATTTGCACCGTGCATATAAACTAGCATGTCAATCTTGCCATTGTCTCTCTCAGTTCCGGCAACGCCGCAATCTCTCTCATCAGGAAAAGCCCTTTCCGGCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131022496
ATGTCAATCTTGCCATTGTCTCTCTCAGTTCCGGCAACGCCGCAATCTCTCTCATCAGGAAAAGCCCTTTCCGGCGGTCCGATATGGGCCCAATCACTGTGCCTCGCCAAAAAACTATCGCACCTCTCCCTCAAAACGACGCCGATTCGGATGGGCGGCGGGCCCCGGACCTACCCGGGAGGGGTCTCGAAGTGGCAGTGGAAGAGGATGCAGGCAAAGAAAGCGAAGCAGCTGCTCAAAGCCCGCTTGGCCCGAGAACG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057807988.1
MSILPLSLSVPATPQSLSSGKALSGGPIWAQSLCLAKKLSHLSLKTTPIRMGGGPRTYPGGVSKWQWKRMQAKKAKQLLKARLARERQIYEMRKRAELKAAVSELERPWEAVEKPPNLFSVSADEQLKVLADRFQKPGGLDLWSERDGPELFRHDNGLPSSRFFPKGVVHSIQPYRKTGKSDTNSDGFEGSGLGEDLDSGRVRANVEKTDLGGNVGGIELRSSDGAAKEGQNRDIKGKFRKKGNRKMYKSAESERMDSGN...

XP_057807990.1
MSILPLSLSVPATPQSLSSGKALSGGPIWAQSLCLAKKLSHLSLKTTPIRMGGGPRTYPGGVSKWQWKRMQAKKAKQLLKARLARERQIYEMRKRAELKAAVSELERPWEAVEKPPNLFSVSADEQLKVLADRFQKPGGLDLWSERDGPELFRHDNGLPSSRFFPKGVVHSIQPYRKTGKSDTNSDGFEGSGLGEDLDSGRVRANVEKTDLGGNVGGIELRSSDGAAKEGQNRDIKGKFRKKGNRKMYKSAESERMDSGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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