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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000632`

染色体: Chr04 坐标: 7195472-7197910 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000632`
名称	SmilChr04G000632
描述	uncharacterized SmilChr04G000632
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7195472 - 7197910 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022509`
GeneID	`131022509`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022509`
原始查询	`SmilChr04G000632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827957]; symbol=AT4G01790; hit=AT4G01790; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827957]; symbol=AT4G01790; hit=AT4G01790; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G01790` (AT4G01790) Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827957] identity=49; qcov=0.782; evalue=1.25e-44; confidence=medium
Rice	`Os07g0636400` (OsRPL30e) - identity=49.3; qcov=0.798; evalue=3.18e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01248 (Ribosomal_L7Ae)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022509

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808010.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808011.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808010.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808010.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7195941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B52,B67
`Chr4:7196863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr4:7197156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808010.1

207 aa

104

207

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 106-159 aa

XP_057808011.1

188 aa

188

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 106-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808010.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	106	159	1.7e-08	34.7	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family
`XP_057808011.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	106	166	4.5e-09	36.6	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952028.1
ACTTTTATCGATGATATAAGACCTGTAAAAATAAATCAAAACCCTAACAATCCTCCCCCATCCTTTAAACTCCCATCTCCGCCGATTCACCGCCGCATCACCACCGCCAATCGTTATTGTTGTTCCACTACGTACTATTGTGCTTCTTCATCTCAACTCCGCTCATTCTCCAACATGTGTCGTCGTCATTGTCCAACGGCACCACACCCCATTCGCGACTCGCTGCCTTCGAGAGCAAATTTGTTACTACTATCTTAGAA...

XM_057952027.1
AACCCTAACAATCCTCCCCCATCCTTTAAACTCCCATCTCCGCCGATTCACCGCCGCATCACCACCGCCAATCGTTATTGTTGTTCCACTACGTACTATTGTGCTTCTTCATCTCAACTCCGCTCATTCTCCAACATGTGTCGTCGTCATTGTCCAACGGCACCACACCCCATTCGCGACTCGCTGCCTTCGAGAGCAAATTTGTTACTACTATCTTAGAACAGAAGAAGAAGAAAATTAAACAGTTTTCTAAGAAGGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022509
ATGCGAAACAAAAAGAGACCCACCGTTGCCGCCGCTGGAGCGCCGCCTCAGACCATTCAAAATACTCTTCCTCATCAACCCCAACTTTGCTTCGAAGATGAAACCCTCGCTCGTTTCCTCAAATCGGTGAAGAGAGAGATTGAATCAGCGAGAGTTCTAGACGAAACTCTGCCTCTTAAGATTTGGATTAAGCAACAATTTGCTGTGGGGGTGAATGAAGTCACGCGTGGACTCGAGCGAATGCCTCCTAATCGCGGGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808010.1
MRNKKRPTVAAAGAPPQTIQNTLPHQPQLCFEDETLARFLKSVKREIESARVLDETLPLKIWIKQQFAVGVNEVTRGLERMPPNRGAESSLVELFGKNVDGDGYFQVILVASDCNPRSLTKHLPALAASRNVPLISVRDRKEGSLRLGELIKVKTAIAIGVKASSHEPGNLYLSLIAPNLFHWLLLSDSLLYLPRNTCRLKETLSIN

XP_057808011.1
MRNKKRPTVAAAGAPPQTIQNTLPHQPQLCFEDETLARFLKSVKREIESARVLDETLPLKIWIKQQFAVGVNEVTRGLERMPPNRGAESSLVELFGKNVDGDGYFQVILVASDCNPRSLTKHLPALAASRNVPLISVRDRKEGSLRLGELIKVKTAIAIGVKAKGNAINQLIKEALTDNKMNSTEEEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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