当前解析结果
SmilChr04G000638| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000638 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000638 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000638 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 7251372 - 7256110 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022491 |
|---|---|
| GeneID | 131022491 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022491 |
| 原始查询 | SmilChr04G000638 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022491 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057807982.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057807982.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057807982.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057807982.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057807982.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:7255066 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,C12,C87,D6 |
Chr4:7255071 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C17 |
Chr4:7255071 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C17 |
Chr4:7255072 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | A24,B103,B105,B16,B53,B74,B79,B8,C18,C20,C37,C42,C51,C75,C80 |
Chr4:7255090 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B66,B76,B8,D10 |
Chr4:7255094 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,B5 |
Chr4:7255108 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B43 |
Chr4:7255124 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B18,B43 |
Chr4:7255187 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D10 |
Chr4:7255187 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:7255217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B42,B43,B5 |
Chr4:7255217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,B43,B5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。