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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000640`

染色体: Chr04 坐标: 7273022-7275924 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000640`
名称	SmilChr04G000640
描述	uncharacterized SmilChr04G000640
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7273022 - 7275924 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022920`
GeneID	`131022920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022920`
原始查询	`SmilChr04G000640`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29; qcov=0.35; evalue=1.24e-21; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=25.8; qcov=0.75; evalue=1.03e-43; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808444.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808444.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808444.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808444.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808444.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7273028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:7273045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C11,C69
`Chr4:7273050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:7273121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	72	A19,A2,A22,A3,A7,B103,B105,B106,B109,B113,B117,B12,B13,B131,B134,B137,B15,B17,B28,B41,B46,B49,B51,B52,B53,B6,B61,B67,B7,B75,B78,B80,B83,B84,B85,B88,B9,B90,B92,C10,C13,C14,C15,C16,C2,C22,C28,C33,C35,C37,C38,C39,C4,C42,C43,C45,C51,C58,C61,C65,C67,C7,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C85,C87,D1,D5
`Chr4:7273124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A8,B1,B128,D6
`Chr4:7273124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B1,B128,D6
`Chr4:7273142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A20,A3,B139,B65,B98,C18,C22,C44,C53,C59,D6
`Chr4:7273190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:7273202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A13,B118,B125,D9
`Chr4:7273202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B118,B125,D9
`Chr4:7273208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B135
`Chr4:7273230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808444.1

749 aa

374

749

RVT_1

PF00078 RVT_1 187-375 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808444.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	187	375	2.3e-19	70.8	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952461.1
ATGGTACGGGTTATGAAAAAATTGAAGCGTCTTCACCCGATTCTCAAGGCTTGGAACAGAGATACCTTTGGGAACTACAATGTTGCCTTAGCTGAGCTTCAACAGGATTTGAACTCTCTTCAGGAGGGGATTGATGAGCAGGGCTACACGGATGACCTTTTTGATCAGGAGGTCAACTTACAGGCTCGTATTGGCACCGTCCTCTTGTGCAAGTCTGAGCATTTGCGACAGCAAAGTAGGGTCTCTTGGCTTTCGGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022920
ATGGTACGGGTTATGAAAAAATTGAAGCGTCTTCACCCGATTCTCAAGGCTTGGAACAGAGATACCTTTGGGAACTACAATGTTGCCTTAGCTGAGCTTCAACAGGATTTGAACTCTCTTCAGGAGGGGATTGATGAGCAGGGCTACACGGATGACCTTTTTGATCAGGAGGTCAACTTACAGGCTCGTATTGGCACCGTCCTCTTGTGCAAGTCTGAGCATTTGCGACAGCAAAGTAGGGTCTCTTGGCTTTCGGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808444.1
MVRVMKKLKRLHPILKAWNRDTFGNYNVALAELQQDLNSLQEGIDEQGYTDDLFDQEVNLQARIGTVLLCKSEHLRQQSRVSWLSDGDMNTRFFHSMVLDFWLHSFLCHLASQADLLTALPSADDIRSVVFSMDRNSAPGSDGFNGAFFQHSWEVVGDDMVAAVRRFFSHGYLPHGLNSNLLYLHLKKADAILVSDYRPIVLGNFFIKVITKILTSRLNAVAAEIVTANQFGFNCMERSIQERNIALKVDIRKAFDTLSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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