当前解析结果
SmilChr04G000641| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000641 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000641 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000641 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 7280264 - 7283951 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022511 |
|---|---|
| GeneID | 131022511 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022511 |
| 原始查询 | SmilChr04G000641 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022511 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808017.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057808019.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057808013.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.40000 | XP_057808019.1 |
| 5 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057808019.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:7282183 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B138 |
Chr4:7283172 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B32,C54,C9 |
Chr4:7283265 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A18,B140,B33,C32,C68,D10,D4 |
Chr4:7283268 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B2 |
Chr4:7283306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,A2,C60,C61 |
Chr4:7283536 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B122,B34,C60,C68 |
Chr4:7283572 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,C14 |
Chr4:7283581 |
GGA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B140,B33,C32,C68,D10,D4 |
Chr4:7283612 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B104,B2 |
Chr4:7283612 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B2 |
Chr4:7283649 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,C32,D10,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
11 records
下载 cDNA FASTA7 records
下载 CDS FASTA7 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。