当前解析结果
SmilChr04G000645| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000645 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000645 |
| 描述 | PRA1 family protein A1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 7294365 - 7297958 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022507 |
|---|---|
| GeneID | 131022507 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022507 |
| 原始查询 | SmilChr04G000645 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | PRA1 family protein A1-like |
| 产物 | PRA1 family protein A1-like |
| Arabidopsis | AT5G05987 (PRA1.A2)prenylated RAB acceptor 1.A2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830485] identity=67.9; qcov=1; evalue=2.35e-109; confidence=high |
| Rice | Os05g0455600- identity=77.5; qcov=1; evalue=3.73e-122; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03208 (PRA1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022507 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057808008.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057808008.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057808008.1 |
| 4 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057808008.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808008.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808008.1PF03208
PRA1 20-192 aa
XP_057808009.1PF03208
PRA1 20-192 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808008.1 |
Pfam | PF03208 |
PRA1 | Family | 20 | 192 | 3.8e-36 | 124.5 | PRA1 family protein |
XP_057808009.1 |
Pfam | PF03208 |
PRA1 | Family | 20 | 192 | 3.8e-36 | 124.5 | PRA1 family protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。