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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000653`

染色体: Chr04 坐标: 7378896-7382441 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000653`
名称	SmilChr04G000653
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7378896 - 7382441 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022480`
GeneID	`131022480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022480`
原始查询	`SmilChr04G000653`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.5-like
Arabidopsis	`AT2G38100` (AT2G38100) proton-dependent oligopeptide transport (POT) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818388] identity=29.8; qcov=0.956; evalue=8.68e-66; confidence=low
Rice	`Os03g0687000` (OsNPF2.4) - identity=26.3; qcov=0.919; evalue=4.73e-37; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057807967.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057807967.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807967.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807967.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7379553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:7380600`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B46
`Chr4:7380600`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B46
`Chr4:7380621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7380627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7380654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:7380837`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	111	A1,A13,A18,A20,A21,A23,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B102,B104,B105,B106,B109,B111,B112,B113,B114,B12,B122,B124,B137,B139,B15,B16,B18,B2,B20,B22,B24,B25,B28,B33,B37,B38,B39,B4,B41,B44,B47,B48,B49,B5,B52,B54,B55,B59,B6,B60,B66,B67,B69,B74,B77,B79,B84,B89,B91,B94,B95,B98,B99,C10,C11,C13,C15,C16,C18,C2,C21,C22,C23,C28,C3,C35,C39,C41,C44,C5,C50,C51,C52,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C64,C66,C67,C69,C72,C75,C76,C78,C8,C80,C82,C84,D10,D11,D3,D4,D5,D7,D8
`Chr4:7380898`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,C35,D4
`Chr4:7380898`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B114,C35,D4
`Chr4:7380900`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,C35,D4
`Chr4:7380900`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B114,C35,D4
`Chr4:7381337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,C13,C39,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807967.1

608 aa

304

608

PTR2

PF00854 PTR2 214-503 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807967.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	214	503	1.2e-18	67.9	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951984.1
ATTAAATTTTAAATGAAAAAACTAGAATTAAATCTGGGGAAGTTTGTACATGTTGGGTATGGTATTTAAGAAAGGTAACCTTCTCTCTCTTCTCTATGCGTAAATTAACAAGAGTGAAGATCAAAAGGCTTGGAATTGAGGAGTAGAGGTAATAATCTGTCTTCTACAAAGAGTAGAAGTGATTAATTGTTTTTACAGGGATGGGTATTCTCAGAGTCGCAGGCCTAGTGTGGGCAGAGACAGTGATGGAAGGCGTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022480
ATGGGTATTCTCAGAGTCGCAGGCCTAGTGTGGGCAGAGACAGTGATGGAAGGCGTCTTCTTCATCATGCAAACTTATTTCACAGATGTTTGGAAGCTGAGCTTCACCAACGCTGCTACAATTCTTAATATTTGGGGTGGACTCTACAGGATTTTACCATTTTTCTTTCTCTTCCTTGCTGACACTCTTCTTGGAAATTTGGTCACGCTTGCACTTTCCGGCATATCCAGCACCGCGGGTATAGTCCTTATCACAGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807967.1
MGILRVAGLVWAETVMEGVFFIMQTYFTDVWKLSFTNAATILNIWGGLYRILPFFFLFLADTLLGNLVTLALSGISSTAGIVLITVATAPVFGHIVSGGRRCQDTEETECVAHTEKLLFMIGLALIALGRAARFASTEPFIEDQTNIKHQDDQTANNKEDETNNKDQTTNYSPDEDETNNNKEKWKPPIWWVLICLLVFFFTPITVIIAFPYVKKWYVLFGVSACITTCATLFYLLGAWTYDKPKQKPEGSNPITDFVRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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