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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000655`

染色体: Chr04 坐标: 7425185-7428253 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000655`
名称	SmilChr04G000655
描述	uncharacterized SmilChr04G000655
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7425185 - 7428253 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022925`
GeneID	`131022925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022925`
原始查询	`SmilChr04G000655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0629600` - identity=24.3; qcov=1.1; evalue=1.42e-14; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808449.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808449.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808449.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808449.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7425390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:7425408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:7425451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:7425466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:7425487`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B99,C21,C58,C78
`Chr4:7425487`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B99,C21,C58,C78
`Chr4:7425692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr4:7425743`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B23
`Chr4:7425743`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B23
`Chr4:7425793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B23,C56,C69
`Chr4:7425801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:7425814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B111,B113,B19,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808449.1

194 aa

194

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 57-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808449.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	57	185	2.9e-12	47.4	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952466.1
TATTATGGACTAGATTAGGATATATTTGATATATTCTAATACTAAGTAAGACAGTTCAAGTGTGAATTACTTAGTCGTAATTGTTGACTCAAGTGTGAATTCCTTAGTCGTAATTGTTGACTAAGGAAGACAAGACAATTTAGAATTGTCTTCTTCGCTTATAAATAAGGAAGCTTGGTCTTACGAATAACATACGAAAACATACGAAAACATTAGCTTAGAGCTTTTGGTTTGCAAACACTAAGAGAGCACTATAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022925
ATGTCGAATTTGTCATTGAAATGTTTGATGGAAACAAATAAGTTGACTGGGTCAAACTTCACGGATTGGCTCCGTTGCTTGCGTCTGGTCTTAAGGCTAGAAAAGATTGAGTATGTCTTGGACAACCCAATCACTGTCATTCCTGACAAGAAGTCTGCTGAGTATGCATCATTTGATGAGGCTGCTCACAAGAAGCATGTCGAGGATGCAACATCGGCACAATGTGTGATGCTGTCCTCTATGACTACGGAGTTACAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808449.1
MSNLSLKCLMETNKLTGSNFTDWLRCLRLVLRLEKIEYVLDNPITVIPDKKSAEYASFDEAAHKKHVEDATSAQCVMLSSMTTELQRQHEHMFPYDMLKHLKSLYASEAQTMEYEILRDLFKCKLHDGGQVSDHVLKMIGLIERLASIGTMLPAIVFVNLILQSLPASFENFIVNFNMNGTKEVQAEEKAEEGI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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