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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000658`

染色体: Chr04 坐标: 7437837-7443944 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000658`
名称	SmilChr04G000658
描述	COBRA-like protein 6
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7437837 - 7443944 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022530`
GeneID	`131022530`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022530`
原始查询	`SmilChr04G000658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COBRA-like protein 6
产物	COBRA-like protein 6
Arabidopsis	`AT1G09790` (COBL6) COBRA-like protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837508] identity=59.4; qcov=0.9; evalue=1.81e-160; confidence=high
Rice	`Os05g0386800` (BC1L4) - identity=52.4; qcov=0.963; evalue=4.87e-156; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0010215 (cellulose microfibril organization); GO:0052324 (plant-type cell wall cellulose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF04833 (COBRA_N); PF25079 (COB_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022530

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808025.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808025.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808025.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808025.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7438565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:7440147`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A18,B112,B114,B15,B37,B41,C56,C59
`Chr4:7440188`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	140	A1,A10,A13,A15,A18,A19,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B118,B12,B123,B124,B125,B126,B13,B131,B133,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B2,B20,B24,B25,B27,B28,B3,B34,B35,B37,B4,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B49,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B6,B62,B63,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B94,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C23,C30,C32,C35,C36,C37,C41,C43,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C60,C62,C66,C67,C68,C69,C72,C75,C76,C77,C81,C82,C84,C87,D10,D11,D3,D4,D6,D8
`Chr4:7440200`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B41
`Chr4:7440200`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7441631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:7441769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B17,C45
`Chr4:7441905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B8,C53,C83,C87
`Chr4:7441948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:7441994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C20
`Chr4:7442151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:7443105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808025.1

450 aa

225

450

COBRA_N

COB_C

PF04833 COBRA_N 63-224 aa PF25079 COB_C 233-422 aa

XP_057808026.1

410 aa

205

410

COBRA_N

COB_C

PF04833 COBRA_N 23-184 aa PF25079 COB_C 193-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808025.1`	Pfam	`PF04833`	COBRA_N	Domain	63	224	2e-58	197.7	COBRA N-terminal domain
`XP_057808025.1`	Pfam	`PF25079`	COB_C	Domain	233	422	1.4e-46	159.9	COBRA family C-terminal domain
`XP_057808026.1`	Pfam	`PF04833`	COBRA_N	Domain	23	184	1.2e-58	198.4	COBRA N-terminal domain
`XP_057808026.1`	Pfam	`PF25079`	COB_C	Domain	193	382	3.6e-47	161.8	COBRA family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952042.1
TAATTTACAGAAATAGTATGGAAAAAAAAAATTAACAAAAAAAAAACGAAATTAAAAGAAGAAACGAAGGAAAAAAAAGTATTCAAAGTTGGAAAAACTTAAGCCAAAACGGCAGCCACCGAGATTTATGAGCTTTGAATGCATAATTCTCGTATAGACACATTCCTGCCACCCCACCTTGTATTTATGGCATCACAATTAATGTTTTCTTATAATTTTTTCGCAAATTTAGATTTCCCAAATCATTAATTAATGTGAAT...

XM_057952043.1
TTTTATTGAAATTGAGTATGATCTCATTCTAGGATTATTTTTTATGGATAAAGCTAGTATTATTAATTGTGCTCTTTCCTTCCGCCGTTACTTTTGTAGGGCTTTGATACGGATATCGATCGTGAACTACCAGCTATTCCGGCAGATGGAGCAGCCGGGGTGGAAGCTAAGCTGGAGATGGCGAGGCAGCGAGGTGATATGGAACATGTTGGGCGCAGAGGCGACTGAGCAGGGAAACTGCTCCTTATTCAAAGGCAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022530
ATGGAGGTGATGCTATGTTGGTTTGTTACGAAGCACAGATTATTAGATATAATCTTGGTGATTAGTTTATTCTGCTGTGCGATTTTTATGTCACCAGCCTATGCGTATGATCCATTGGATCCTAATGGGAACATCACCATCAGATGGGATGTCTTGCAAGAAAACGACGATTCTTCAAAAGATATACGGATATCGATCGTGAACTACCAGCTATTCCGGCAGATGGAGCAGCCGGGGTGGAAGCTAAGCTGGAGATGGCG...

LOC131022530
ATGGATAAAGCTAGTATTATTAATTGTGCTCTTTCCTTCCGCCGTTACTTTTGTAGGGCTTTGATACGGATATCGATCGTGAACTACCAGCTATTCCGGCAGATGGAGCAGCCGGGGTGGAAGCTAAGCTGGAGATGGCGAGGCAGCGAGGTGATATGGAACATGTTGGGCGCAGAGGCGACTGAGCAGGGAAACTGCTCCTTATTCAAAGGCAAAGTTCTGCCGCATTGCTGCGAAAGGGAGCCCGTCATAATCGACCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808025.1
MEVMLCWFVTKHRLLDIILVISLFCCAIFMSPAYAYDPLDPNGNITIRWDVLQENDDSSKDIRISIVNYQLFRQMEQPGWKLSWRWRGSEVIWNMLGAEATEQGNCSLFKGKVLPHCCEREPVIIDLLPAAPYNKQVANCCRGGILTSVTQDPAKHISAFQMHIGTADADGPSSKPGMPTAFSLGAPGYTCGEAVQVPPTKFAEDQGRRRTQAFETWNVTCTYSQFRASPAPSCCVSLSAFYNQTIVKCPQCSCACQEQA...

XP_057808026.1
MDKASIINCALSFRRYFCRALIRISIVNYQLFRQMEQPGWKLSWRWRGSEVIWNMLGAEATEQGNCSLFKGKVLPHCCEREPVIIDLLPAAPYNKQVANCCRGGILTSVTQDPAKHISAFQMHIGTADADGPSSKPGMPTAFSLGAPGYTCGEAVQVPPTKFAEDQGRRRTQAFETWNVTCTYSQFRASPAPSCCVSLSAFYNQTIVKCPQCSCACQEQAGTQCVKVGEWSPPQLQLSHNEPAKPVVQCTNHMCPIKVHW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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