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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000659`

染色体: Chr04 坐标: 7448271-7451141 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000659`
名称	SmilChr04G000659
描述	probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase A6
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7448271 - 7451141 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022531`
GeneID	`131022531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022531`
原始查询	`SmilChr04G000659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase A6
产物	probable glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase A6
Arabidopsis	`AT3G23770` (AT3G23770) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821959] identity=58.5; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0502200` - identity=47; qcov=0.994; evalue=4.97e-150; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057808027.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808027.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808027.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808027.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808027.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7448630`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A21,B113,B44,C16
`Chr4:7448630`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A21,B113,B44,C16
`Chr4:7448655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:7448700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C61
`Chr4:7448859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A8,C84
`Chr4:7448929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79
`Chr4:7448972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,C39,C51,C57
`Chr4:7449212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:7449417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B14,B34
`Chr4:7449435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7449449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B29
`Chr4:7450566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808027.1

467 aa

234

467

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 26-347 aa PF07983 X8 377-448 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808027.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	26	347	1.1e-99	334.7	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057808027.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	377	448	2.5e-14	54.4	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952044.1
CCTTATTCTCCAACCAAAAAGTATTCATCTTTCTTTTATCCTACATGACACAAAGACCATTGGGCAGCATCCTCTTGAATTCGGAAGTTGAAGACTTTCTGCATAGTTTCCCACTATATATGTAGGATTACTCACATCACATTTTGACACACACAAACAGGAGGAAAAGCAACAATGAAGAAGACTATTTTCGCTCTCTCACTATGTTATATAGTTTCTCTCTCATCTGCATTACTAGGCTCGGACAAGATCGGCATAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022531
ATGAAGAAGACTATTTTCGCTCTCTCACTATGTTATATAGTTTCTCTCTCATCTGCATTACTAGGCTCGGACAAGATCGGCATAAACTACGGCCGGATCGGAAACAACCTGCCGTCGCCCTACCGCTCCATCGAGCTTCTCCAATCGATGAACATCCGACACGTGAAGCTTTACGACTCCGACCCCGAAGTCCTAAAGCTTCTCTCGGGCATCAACATCCACGTCACGGTCATGGTCCCCAACGACCAGATCTCGCGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808027.1
MKKTIFALSLCYIVSLSSALLGSDKIGINYGRIGNNLPSPYRSIELLQSMNIRHVKLYDSDPEVLKLLSGINIHVTVMVPNDQISRIASNRSEADEWVNKNVLAYYPSTKIRFVLVGNEVFSHNDQRVMWLDLAPAMRYIRKSLSEHDIHNIKVGTPVAMDVLESSFPPSAGKFRPDVAEVMTSVVKFLNGTRSFFFLDVYPFFPWSENPTNMSLDFALLKEGNGTYIDPNTGLIYTNLLDQMLDSVNFAMEKIGFHDVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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