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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000665`

染色体: Chr04 坐标: 7505399-7506512 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000665`
名称	SmilChr04G000665
描述	uncharacterized protein At2g39795, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7505399 - 7506512 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022539`
GeneID	`131022539`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022539`
原始查询	`SmilChr04G000665`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0326500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0326500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G39795` (AT2G39795) Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818565] identity=26.6; qcov=0.949; evalue=3.79e-11; confidence=low
Rice	`Os06g0326500` - identity=28.7; qcov=0.665; evalue=5.06e-13; confidence=low
GO	GO:0005759 (mitochondrial matrix)
KEGG	-
Pfam	PF02330 (MAM33)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022539

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057808030.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808030.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808030.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808030.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7505606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr4:7505931`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A11,A23,A3,B10,B105,B123,B127,B129,B137,B16,B44,B5,B53,B58,B61,B9,B95,C10,C11,C20,C24,C27,C37,C4,C52,C71
`Chr4:7506168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr4:7506304`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B138
`Chr4:7506304`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B138
`Chr4:7506350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:7506392`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B41
`Chr4:7506392`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808030.1

257 aa

128

257

MAM33

PF02330 MAM33 48-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808030.1`	Pfam	`PF02330`	MAM33	Domain	48	232	1.5e-20	74.8	Mitochondrial glycoprotein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952047.1
CCCACCCAGAGCAAAGCAACTAATAATTAAGCATGCTTCGCGCAGCTTCAACTAAACTATTTCGCGCCAGAAATACATTCTCTAATCCTCTCCTTTGCCGCCGCCGTTTCTCCGCCGCTGCCCCATTCGAGCGCTACGTAATCGACGCTCACAAAATCCTCGCCGATGCATTGGATTCCGAAATCAAACACACTCAGATGATCTCCTTGAGGCCAGCAGCCCCAGCTGATTTCCCTTTCAAATTGCAACACACTCCCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022539
ATGCTTCGCGCAGCTTCAACTAAACTATTTCGCGCCAGAAATACATTCTCTAATCCTCTCCTTTGCCGCCGCCGTTTCTCCGCCGCTGCCCCATTCGAGCGCTACGTAATCGACGCTCACAAAATCCTCGCCGATGCATTGGATTCCGAAATCAAACACACTCAGATGATCTCCTTGAGGCCAGCAGCCCCAGCTGATTTCCCTTTCAAATTGCAACACACTCCCAGCGAGCGCGTCAAGCTGACGAGGGAGCTCGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808030.1
MLRAASTKLFRARNTFSNPLLCRRRFSAAAPFERYVIDAHKILADALDSEIKHTQMISLRPAAPADFPFKLQHTPSERVKLTRELDGEEIEVMLLGNDQNHDADEDDGATTTDSDSDTDDCPDSDEESPAKSATDLIIKISKPNGKSMKFFATASRSADKIEIQRLTTKDGDGDNNVVCSQLFIAPESELQMALREFLEVRGIKKSIAKFLYDYMNWKSKLPYDGVLRSVEAYSAEKSVQDKNIRMLRKLKKIIKDW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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