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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000686`

染色体: Chr04 坐标: 8010331-8011755 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000686`
名称	SmilChr04G000686
描述	protein PSK SIMULATOR 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8010331 - 8011755 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022934`
GeneID	`131022934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022934`
原始查询	`SmilChr04G000686`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PSK SIMULATOR 2-like
产物	protein PSK SIMULATOR 2-like
Arabidopsis	`AT3G23160` (AT3G23160) plant/protein (DUF668) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821892] identity=36.7; qcov=1.02; evalue=2.73e-85; confidence=medium
Rice	`Os05g0457600` (OJ1362_D02.2) - identity=35; qcov=1.02; evalue=5.21e-69; confidence=low
GO	GO:0045927 (positive regulation of growth)
KEGG	-
Pfam	PF05003 (DUF668); PF11961 (DUF3475)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808457.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808457.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808457.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057808457.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808457.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8010599`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr4:8010599`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr4:8010601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr4:8010745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B98,C18,C22,C44
`Chr4:8010839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,A8
`Chr4:8011360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:8011731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808457.1

474 aa

237

474

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 39-94 aa PF05003 DUF668 329-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808457.1`	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	39	94	1.7e-22	79.9	Domain of unknown function (DUF3475)
`XP_057808457.1`	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	329	417	4.4e-28	98.3	Protein of unknown function (DUF668)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952474.1
ATGGTCGGTTTCAAGCATAAGGGTTGGCTGCCGGAGATCGCCTCCTCCAAAAAAGACCACCACGCTCGCCGCCGTTGCGCCGACGAGTCAAAGAAGAAGGCCCCTCGTTTGCGAATCCTCGCATTCGAGACCGCCAAATCCATGTCGAGGTTGATCTCTCTCTACAAATCTCTCTCCGACGGTCAGATCTCCCGCCTGAAAAACCGCATCATCAAATCCAAAGGAATTTCGTACCTGACCTCCACGGACGAGGAGTTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022934
ATGGTCGGTTTCAAGCATAAGGGTTGGCTGCCGGAGATCGCCTCCTCCAAAAAAGACCACCACGCTCGCCGCCGTTGCGCCGACGAGTCAAAGAAGAAGGCCCCTCGTTTGCGAATCCTCGCATTCGAGACCGCCAAATCCATGTCGAGGTTGATCTCTCTCTACAAATCTCTCTCCGACGGTCAGATCTCCCGCCTGAAAAACCGCATCATCAAATCCAAAGGAATTTCGTACCTGACCTCCACGGACGAGGAGTTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808457.1
MVGFKHKGWLPEIASSKKDHHARRRCADESKKKAPRLRILAFETAKSMSRLISLYKSLSDGQISRLKNRIIKSKGISYLTSTDEEFLLSLACGERTEDLDHAAAVVSRLGKKCGDPWLNQFDLVYTDLKLGVLDFGKLEYGSRYAEKRVRKMEKLVSATASLHAALAALAEMEAAERKMKRRNKQMELDANSDLFNQKLEIQRKDVKYLKETSLWRKSCDKCVSIMATIVIIVYIRICSVFKPYITILPSISLLNVACFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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