当前解析结果
SmilChr04G000697| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000697 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000697 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000697 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 8136306 - 8136901 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022566 |
|---|---|
| GeneID | 131022566 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022566 |
| 原始查询 | SmilChr04G000697 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transmembrane protein (DUF962) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820062]; symbol=AT3G09085; hit=AT3G09085; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | transmembrane protein (DUF962) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820062]; symbol=AT3G09085; hit=AT3G09085; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G09085 (AT3G09085)transmembrane protein (DUF962) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820062] identity=70; qcov=0.982; evalue=3.79e-56; confidence=high |
| Rice | Os03g0265800- identity=59.6; qcov=0.929; evalue=1.64e-38; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06127 (Mpo1-like) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022566 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057808059.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057808059.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057808059.1 |
| 4 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.20000 | XP_057808059.1 |
| 5 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.20000 | XP_057808059.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808059.1PF06127
Mpo1-like 3-96 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808059.1 |
Pfam | PF06127 |
Mpo1-like | Family | 3 | 96 | 2.3e-32 | 111.7 | 2-hydroxy-palmitic acid dioxygenase Mpo1-like |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。