当前解析结果
SmilChr04G000721| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000721 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000721 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000721 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 8461382 - 8467777 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022583 |
|---|---|
| GeneID | 131022583 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022583 |
| 原始查询 | SmilChr04G000721 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | DNA GYRASE B3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830289]; symbol=GYRB3; hit=AT5G04110; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | DNA GYRASE B3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830289]; symbol=GYRB3; hit=AT5G04110; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G04110 (GYRB3)DNA GYRASE B3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830289] identity=45.2; qcov=0.382; evalue=8.6e-46; confidence=low |
| Rice | Os04g0166400- identity=32.3; qcov=0.662; evalue=3.04e-43; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022583 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808077.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808077.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808077.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808077.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057808077.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:8461870 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C39,C75 |
Chr4:8461871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B62,B9,C30,C72 |
Chr4:8461877 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,C15 |
Chr4:8462027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B108,B27,B35,C43 |
Chr4:8462216 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C57,C64,C66 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。