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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000724`

染色体: Chr04 坐标: 8503069-8506110 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000724`
名称	SmilChr04G000724
描述	laccase-4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8503069 - 8506110 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022582`
GeneID	`131022582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022582`
原始查询	`SmilChr04G000724`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-4-like
产物	laccase-4-like
Arabidopsis	`AT2G38080` (IRX12) Laccase/Diphenol oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818386] identity=74.8; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0634500` (OsLAC2) - identity=62.1; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057808075.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808075.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808075.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808075.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8503250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:8503681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B41,D10
`Chr4:8503891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B18
`Chr4:8503900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:8504093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:8504351`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A20,B46,B50,C19,C54
`Chr4:8504351`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A20,B46,B50,C19,C54
`Chr4:8504467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C8
`Chr4:8504490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:8504580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A21,B109,B110,B114,B118,B120,B135,B137,B140,B22,B37,B40,B42,B43,B49,B60,B72,B8,B90,B92,C1,C11,C15,C21,C25,C29,C34,C49,C52,C69,C8
`Chr4:8504639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C15,C52
`Chr4:8504672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808075.1

580 aa

290

580

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 30-143 aa PF00394 Cu-oxidase 156-330 aa PF07731 Cu-oxidase_2 431-563 aa

XP_057808076.1

557 aa

278

557

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 30-143 aa PF00394 Cu-oxidase 156-307 aa PF07731 Cu-oxidase_2 408-540 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808075.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	30	143	5.6e-42	143.3	Multicopper oxidase
`XP_057808075.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	156	330	3e-48	164.6	Multicopper oxidase
`XP_057808075.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	431	563	4.2e-47	160.1	Multicopper oxidase
`XP_057808076.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	30	143	4.1e-42	143.7	Multicopper oxidase
`XP_057808076.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	156	307	3.7e-50	170.8	Multicopper oxidase
`XP_057808076.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	408	540	2.2e-47	161.0	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952092.1
GAATGCAACTCTCTAAGACAGACATATCAACTGCTTAACAAAACCCCTTCTCTCTTCTCTTACATTAATCTAACATCTCTCTCTCTAAACAAACGAGTAGAGAGATGGAAGTCTGGGTTCGTGTTTTGATCCTCGTAGCATGCATGTATCCCCTTATGGTTGACGGCGCTGTTCGCCGTTACCAGTTCAATGTGATGATGAAGAACACATCTCGCCTATGCTCTTCCAAATCCATCGTCACCGTCAACGGAAAATTCCCC...

XM_057952093.1
GAATGCAACTCTCTAAGACAGACATATCAACTGCTTAACAAAACCCCTTCTCTCTTCTCTTACATTAATCTAACATCTCTCTCTCTAAACAAACGAGTAGAGAGATGGAAGTCTGGGTTCGTGTTTTGATCCTCGTAGCATGCATGTATCCCCTTATGGTTGACGGCGCTGTTCGCCGTTACCAGTTCAATGTGATGATGAAGAACACATCTCGCCTATGCTCTTCCAAATCCATCGTCACCGTCAACGGAAAATTCCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022582
ATGGAAGTCTGGGTTCGTGTTTTGATCCTCGTAGCATGCATGTATCCCCTTATGGTTGACGGCGCTGTTCGCCGTTACCAGTTCAATGTGATGATGAAGAACACATCTCGCCTATGCTCTTCCAAATCCATCGTCACCGTCAACGGAAAATTCCCCGGCCCGACACTCTACGCGAGGGAAGACGACACCGTCCTCGTCCGAGTCATCAACCGAGTCCAGTACAACGTTTCCATCCACTGGCATGGAATTAGGCAACTCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808075.1
MEVWVRVLILVACMYPLMVDGAVRRYQFNVMMKNTSRLCSSKSIVTVNGKFPGPTLYAREDDTVLVRVINRVQYNVSIHWHGIRQLGTGWADGPAYITQCPIRPGHSYVYKFTVTGQRGTLLWHAHILWLRATVHGAIVILPKRGVPYPFPKPDHEHVVVLGEWWKSDTEAVINEAMKSGVAPNVSDAHTINGHPGPLSNCPTTGKNMIKIHIYKCDHLTNFIFYFVGGFSLNVSPGKTYMLRLINAALNEELFFKIAGH...

XP_057808076.1
MEVWVRVLILVACMYPLMVDGAVRRYQFNVMMKNTSRLCSSKSIVTVNGKFPGPTLYAREDDTVLVRVINRVQYNVSIHWHGIRQLGTGWADGPAYITQCPIRPGHSYVYKFTVTGQRGTLLWHAHILWLRATVHGAIVILPKRGVPYPFPKPDHEHVVVLGEWWKSDTEAVINEAMKSGVAPNVSDAHTINGHPGPLSNCPTTGGFSLNVSPGKTYMLRLINAALNEELFFKIAGHKLTVVEVDATYVKPFKTDTVLIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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