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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000725`

染色体: Chr04 坐标: 8518608-8520353 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000725`
名称	SmilChr04G000725
描述	uncharacterized SmilChr04G000725
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8518608 - 8520353 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022947`
GeneID	`131022947`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022947`
原始查询	`SmilChr04G000725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=34.6; qcov=0.403; evalue=3.83e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022947

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808470.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808470.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808470.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057808470.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808470.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8518611`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A11,A7,B19,B3,B46,B64,B70,B99,C15,C29,C36,C40,C45,C46,C48,C7,C80
`Chr4:8518653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B35,C69,D10
`Chr4:8518654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:8518666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C78
`Chr4:8518667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C13
`Chr4:8518678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C13
`Chr4:8518730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:8518743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B3,B41,B59,B61
`Chr4:8518745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:8518755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B9,B95
`Chr4:8518758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:8518764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808470.1

581 aa

290

581

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 34-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808470.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	34	99	5.2e-09	37.0	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952487.1
ATGACGACAAGGTCCCACCCCACCAGCAGCCGGAGTCCTTTTTCCGCTGATATCTTGGCGAATACTCTACCAAGGAGTTACAAACCTATTTCTCTAGATTACGATGGTACCACCGACCCAGAGGTACACCTCAACCGGTTTGAGGGACTGGTCACTCTTCACATGTACACAGAGGGCATCAACTGCTGGATATTCTCCACCACGTTAACTGGACCCACCCAATTGTGGTTTGGGACGCTCGCCCCAAATTCTATTCACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022947
ATGACGACAAGGTCCCACCCCACCAGCAGCCGGAGTCCTTTTTCCGCTGATATCTTGGCGAATACTCTACCAAGGAGTTACAAACCTATTTCTCTAGATTACGATGGTACCACCGACCCAGAGGTACACCTCAACCGGTTTGAGGGACTGGTCACTCTTCACATGTACACAGAGGGCATCAACTGCTGGATATTCTCCACCACGTTAACTGGACCCACCCAATTGTGGTTTGGGACGCTCGCCCCAAATTCTATTCACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808470.1
MTTRSHPTSSRSPFSADILANTLPRSYKPISLDYDGTTDPEVHLNRFEGLVTLHMYTEGINCWIFSTTLTGPTQLWFGTLAPNSIHSFEDLQTRFLRQFASSRRVGKSALSLMDIKQDQNETLREYTARFNLAALEVPEAESQIKNCAYVRGLKPGLFFDELQITPTRDFDDIMARLLGYLQLEDTRMARKAENDKHKAKRAEEAPERNNRHQDRAPLRGLPPRVPPPQAEGPPRQQRTVNEVNRFDEYTPLNKPQEEIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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