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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000726`

染色体: Chr04 坐标: 8530086-8532678 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000726`
名称	SmilChr04G000726
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8530086 - 8532678 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022948`
GeneID	`131022948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022948`
原始查询	`SmilChr04G000726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=27.5; qcov=1.1; evalue=1.18e-43; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=24.9; qcov=1.1; evalue=1.39e-33; confidence=weak
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808472.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808472.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808472.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808472.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8530759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A9,B22,B98,C1,C44
`Chr4:8530759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B22,B98,C1,C44
`Chr4:8530771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr4:8530807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B53
`Chr4:8530816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr4:8530817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B62,B9,C30,C72
`Chr4:8530843`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A22,A5,B126,B30
`Chr4:8530843`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A22,A5,B126,B30
`Chr4:8530881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:8530904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B55,D9
`Chr4:8530914`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A10,A21,B109,B11,B119,B26,B41,B44,B52,B56,B67,B7,B83,B88,C11,C83,D9
`Chr4:8530955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808472.1

444 aa

222

444

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 43-138 aa PF10551 MULE 236-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808472.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	43	138	2.6e-11	44.8	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057808472.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	236	306	2e-12	48.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952489.1
ATGTCCGACGAAGATGTTCATAGATCTCGTGATGAACAATATATTATTGACTTAGTCACACCCACGTGTGATCCTCAATTGATTCCATTTGAGGGACAAATATTTCCTACATTGGAGTTGGGTGTCAAATTCTATGAGGAGTACGCGGATGCAGCTGGCTTTGAGACACATCTAAGTACGCCCAAAAAAACGGAAGACAGTACCATGCTTTATAGGTATGTGTTATATAACCGAGCTGGATTGAAGCCCAAGAAAAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022948
ATGTCCGACGAAGATGTTCATAGATCTCGTGATGAACAATATATTATTGACTTAGTCACACCCACGTGTGATCCTCAATTGATTCCATTTGAGGGACAAATATTTCCTACATTGGAGTTGGGTGTCAAATTCTATGAGGAGTACGCGGATGCAGCTGGCTTTGAGACACATCTAAGTACGCCCAAAAAAACGGAAGACAGTACCATGCTTTATAGGTATGTGTTATATAACCGAGCTGGATTGAAGCCCAAGAAAAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808472.1
MSDEDVHRSRDEQYIIDLVTPTCDPQLIPFEGQIFPTLELGVKFYEEYADAAGFETHLSTPKKTEDSTMLYRYVLYNRAGLKPKKKIPSNTKGNEPKKQRQTVSIRVECMAHIVLRHAGNRGYRVTTFDEEHTHNMVPEGQRHLMNSKRNVNYIHQMMMLTGMKANIGPMKTFRFYKELVGGYDDVGCTPQDFKNYGRDLRAFSDGVDARILLDNFRDKQESCPGFKFSFDTFEDTTLKRLYKMILTPFTGRDNHGRCIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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