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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000729`

染色体: Chr04 坐标: 8619037-8620930 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000729`
名称	SmilChr04G000729
描述	transcription factor DIVARICATA-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8619037 - 8620930 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022585`
GeneID	`131022585`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022585`
原始查询	`SmilChr04G000729`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor DIVARICATA-like
产物	transcription factor DIVARICATA-like
Arabidopsis	`AT2G38090` (AT2G38090) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818387] identity=66.2; qcov=0.724; evalue=1.68e-102; confidence=high
Rice	`Os01g0853700` - identity=56.6; qcov=0.673; evalue=8.78e-72; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022585

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808081.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808081.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808081.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808081.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8620049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:8620074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B52
`Chr4:8620077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B44
`Chr4:8620097`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A10,C13
`Chr4:8620097`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A10,C13
`Chr4:8620101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C13
`Chr4:8620202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C35
`Chr4:8620202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:8620208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:8620219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,C11,C69,C84,D10
`Chr4:8620270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr4:8620321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808081.1

315 aa

158

315

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 27-72 aa PF00249 Myb_DNA-binding 136-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808081.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	27	72	1.2e-21	77.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057808081.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	136	182	1.2e-21	77.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952098.1
TCAATTACAGAAACGCCCATCTGCAATGACAGATTGTCCTTTTCTGTATTTCATCACCCACCCCTCTCTCTCTCTCCCTGAAAAAGTTTCAGTCAGCTGAAGTCCCCACAGACACCTTCCGACCAATCATTCACGAACACCTTCAATCTATTACACATATTTATGGCTGAAAATCCCTGCATCTAAACAAAACACAAAAGTACAACTAAAACTTCAAAACACACACACACTCAGTAACTATCTTTACCTCTCATCATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022585
ATGAACAGAGAAATCGCGTCGTATCTCAGCAGCACCACCTCGTCCAACTGGCTGTTCGAAGACGGCAGCGCCGTCGCGAAATGGACGGTGGAGGAGAACAAGCGCTTCGAGAACGCCCTCGCATTGTTCGACAAGGACACCCCCGACCGCTGGCACAATGTCGCCTCCATGATCCCGGGAAAATCCGTCACCGACGTCATCAAACAATACCGTGAATTGGTCGATGACGTCAGCGACATCGAGGCCGGCCTCATCCCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808081.1
MNREIASYLSSTTSSNWLFEDGSAVAKWTVEENKRFENALALFDKDTPDRWHNVASMIPGKSVTDVIKQYRELVDDVSDIEAGLIPVPGYSANSFTLEWMAADRTFHGFNHLYSPAAAKRNPSSARCNDHERKKGVPWTEEEHRQFLLGLKKYGKGDWRNISRNFVTSRTPTQVASHAQKYFIRQLSGGKDKRRSSIHDITTVNLEEAKSPSPEKEGPDSPQKSSLILQQQRCVDGEVVVRGRYDSELSNEGCVMGFGPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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