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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000752`

染色体: Chr04 坐标: 9217409-9225574 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000752`
名称	SmilChr04G000752
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g13965
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	9217409 - 9225574 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022606`
GeneID	`131022606`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022606`
原始查询	`SmilChr04G000752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g13965
产物	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g13965
Arabidopsis	`AT4G00160` (AT4G00160) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828180] identity=26; qcov=0.995; evalue=1.91e-17; confidence=low
Rice	`Os11g0533800` (OsFbox602) - identity=21.4; qcov=0.998; evalue=6.32e-16; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08387 (FBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022606

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808100.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808100.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808100.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808100.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:9217731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr4:9217820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B131,B57,C27,C55
`Chr4:9217866`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C40,C5
`Chr4:9217866`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C40,C5
`Chr4:9217884`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C40,C5
`Chr4:9217884`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C40,C5
`Chr4:9217887`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C40,C5
`Chr4:9217887`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C40,C5
`Chr4:9218044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B35,C61
`Chr4:9218061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B35
`Chr4:9218072`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B54,C43
`Chr4:9218072`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B54,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808100.1

417 aa

208

417

F-box

FBD

PF00646 F-box 36-74 aa PF08387 FBD 345-383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808100.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	36	74	2e-06	28.2	F-box domain
`XP_057808100.1`	Pfam	`PF08387`	FBD	Repeat	345	383	6.8e-06	26.6	FBD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952117.1
ATCGTATAAATGAAATAGCAATAGAAAGAATTCTCATATCTCTCCTTTCATATCTCTGTCTCTCCCTGGTCCCTCTCTCACCGGCACTGCTGCACCTCGACGACGTCTCGCCTCGACATCACGGCCAGCAGAGCAACCCTCCGTCGTCTCCACCTTGGCTAGTGTTTTGGGCGGTTGGTTCAGTTCGATTTTGAGCCGATGCATACTCATACTGATCATTGGAATTTGTGTGATGTTGCAGAAGCACTCCCAGATGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022606
ATGCATACTCATACTGATCATTGGAATTTGTGTGATGTTGCAGAAGCACTCCCAGATGATGATACAATGGAGTGTTGTGAGAGATGCGATGGTGGAGTTGATAGGTTAAGTGAGTTGCCTAATGAAATTATCCTTGTCATACTGTCCTTCCTGTCGCTGGGGGAATGTGTAACCACTAGCGTTCTTTCTTCCCGATGGTCGGATTTGTGGAAACACATCCCTAATCTCAACTTGGATGCGAAGCTTCTGACAAACGATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808100.1
MHTHTDHWNLCDVAEALPDDDTMECCERCDGGVDRLSELPNEIILVILSFLSLGECVTTSVLSSRWSDLWKHIPNLNLDAKLLTNDYHSLIRGSKWDAERCKYIEIVNSVLQSHKSPSLKEFRISLYANESAQCAVAKWLEFGISRQVEKLELDLQCQDSKVCLPQNLIGFKSLKSLCLKYFKVSGQAIDSLLRNCPLLEELYIHSSILTSDIVVCGTALALKHFDINVCYGLPVGENTIKISAPNLTWLRLCTTHKLVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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