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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000758`

染色体: Chr04 坐标: 9252657-9255074 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000758`
名称	SmilChr04G000758
描述	uncharacterized SmilChr04G000758
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	9252657 - 9255074 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022607`
GeneID	`131022607`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022607`
原始查询	`SmilChr04G000758`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828180]; symbol=AT4G00160; hit=AT4G00160; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828180]; symbol=AT4G00160; hit=AT4G00160; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G00160` (AT4G00160) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828180] identity=27.9; qcov=0.846; evalue=5.82e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07723 (LRR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022607

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808101.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808101.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808101.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808101.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:9252779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C2,C69,C84
`Chr4:9252798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C49
`Chr4:9252806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C49
`Chr4:9252820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C36,C49,C65
`Chr4:9252839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr4:9252843`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C49
`Chr4:9252843`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C49
`Chr4:9252848`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B30,C49
`Chr4:9252848`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B30,C49
`Chr4:9252850`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B30,C49
`Chr4:9252850`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B30,C49
`Chr4:9252855`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	59	A1,A11,A18,A2,A20,A4,A6,A9,B103,B106,B110,B118,B122,B135,B19,B31,B34,B35,B38,B39,B48,B5,B6,B60,B70,B73,B74,B82,B95,C1,C12,C16,C17,C19,C20,C28,C31,C35,C39,C4,C45,C46,C50,C53,C58,C60,C61,C62,C63,C74,C8,C80,C81,C83,D1,D3,D4,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808101.1

182 aa

182

LRR_2

PF07723 LRR_2 147-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808101.1`	Pfam	`PF07723`	LRR_2	Repeat	147	171	3.2e-05	25.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101354.1
TTTGACGAAGTAAGCCCTAATTCGAAATAGAGAACTGTCCCCCCACATTTCTGAACTGAAACTCAAACACCAGACACCAAATCACGCAGCTGCTCATGGCGGTCTTGCCTGGGTTCGACGGCGCAGGGGAGCGGCGGCTGCTCACGGCGGTCTTGCTCGACGGCGCCGGCTCTGGAAATTGATTGAAGTAGTGATGGAGGTGAAGTATTTCAAATCCGATTCAGATTTTCTGCCCAAGAAGTGTTCTCGGAGATGCAATG...

XR_009101353.1
TTTGACGAAGTAAGCCCTAATTCGAAATAGAGAACTGTCCCCCCACATTTCTGAACTGAAACTCAAACACCAGACACCAAATCACGCAGCTGCTCATGGCGGTCTTGCCTGGGTTCGACGGCGCAGGGGAGCGGCGGCTGCTCACGGCGGTCTTGCTCGACGGCGCCGGCTCTGGGTATCCTTAATTTTCTTGTGCTAGTTTTTTAAATAAATGTTATTTCCATGGAATTCATAATGTGCATGTGCTGAATTAAGGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022607
ATGGAGGTGAAGTATTTCAAATCCGATTCAGATTTTCTGCCCAAGAAGTGTTCTCGGAGATGCAATGGTGGAGTTGATAGGATTAGTTTGTGGAAACACGTCCCTAATCTCAACTTGAATGCAAAGCTTCTAACCAACCATTATCAAGAGCCTATACGAGGAAGCGCATGGGATGCTGAAAGGTGCAAGTATATAGAAATAGTAAGCTCGGTTCTCCAATCGCGTAAAGCCCCTTTGCTGAAAGAATTAAGAATCTCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808101.1
MEVKYFKSDSDFLPKKCSRRCNGGVDRISLWKHVPNLNLNAKLLTNHYQEPIRGSAWDAERCKYIEIVSSVLQSRKAPLLKELRISLYANKSAQCAVAKWLEFVVSRQVERLRLDFLCVGPSDVVSCEELLGDNKVCLPQNLIGYKSLKSLHLRWFKVSGEAIESFLRNCPCWRNCISNIQF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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