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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000759`

染色体: Chr04 坐标: 9256773-9259030 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000759`
名称	SmilChr04G000759
描述	putative FBD-associated F-box protein At3g50710
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	9256773 - 9259030 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022957`
GeneID	`131022957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022957`
原始查询	`SmilChr04G000759`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative FBD-associated F-box protein At3g50710
产物	putative FBD-associated F-box protein At3g50710
Arabidopsis	`AT4G00160` (AT4G00160) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828180] identity=34.6; qcov=0.382; evalue=2.91e-13; confidence=low
Rice	`Os10g0129100` (OsFbox519) - identity=30.2; qcov=0.379; evalue=6.38e-11; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808480.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808480.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808480.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808480.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:9256804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:9256820`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A10,A24,A5,A7,B101,B114,B131,B136,B14,B15,B21,B22,B26,B29,B34,B35,B36,B37,B47,B48,B49,B56,B60,B61,B68,B72,B74,B83,B85,B88,B89,B90,B92,B93,C10,C23,C29,C38,C40,C42,C5,C56,C57,C7,C70,C71,C73,C8,C80,C81,C86
`Chr4:9256889`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B108
`Chr4:9256889`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B108
`Chr4:9257800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:9257841`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A20,C19,C54
`Chr4:9257841`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A20,C19,C54
`Chr4:9257870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,D7,D8
`Chr4:9257907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C2,C69,C84
`Chr4:9258043`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A10,A24,A5,B101,B131,B136,B14,B15,B22,B26,B29,B34,B37,B47,B56,B60,B68,B74,B83,B85,B88,B89,B93,B96,C10,C23,C38,C42,C56,C57,C7,C70,C73,C8,C80,C81,C86
`Chr4:9258069`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A21,B22,B41,B75,B96,C63,C8
`Chr4:9258110`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A21,B22,B41,B75,B96,C63,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808480.1

340 aa

170

340

F-box

PF00646 F-box 14-52 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808480.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	14	52	1.1e-06	29.0	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952497.1
ATGGAGTGTTCTCGGAGATGCGATGGTGGAGTTCATAGGATTAGTGAGTTGCCTGATGAAATTGTTCTTGTCATATTGTCTTTCCTATCATTGAGGGAATCTGTAACCACTAGTGTTCTTTCTTCCCGATGGTTGGATTTGTGGAAACACATCCCTAATCTCAACTTGGATGCGAAGCTTCTAACCAACCAATATAAGAAGCCTATACGACGAAGCAATACATGGTATGCTGAAATGTGCAAGTATATAGAAATAGTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022957
ATGGAGTGTTCTCGGAGATGCGATGGTGGAGTTCATAGGATTAGTGAGTTGCCTGATGAAATTGTTCTTGTCATATTGTCTTTCCTATCATTGAGGGAATCTGTAACCACTAGTGTTCTTTCTTCCCGATGGTTGGATTTGTGGAAACACATCCCTAATCTCAACTTGGATGCGAAGCTTCTAACCAACCAATATAAGAAGCCTATACGACGAAGCAATACATGGTATGCTGAAATGTGCAAGTATATAGAAATAGTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808480.1
MECSRRCDGGVHRISELPDEIVLVILSFLSLRESVTTSVLSSRWLDLWKHIPNLNLDAKLLTNQYKKPIRRSNTWYAEMCKYIEIVNSVLQPHKAPWLKEFRISLIADKSAQCAVTKWLEFVLSRQVERLELDLQCQGTCIKVSSYVVSLEELLKDRPQNLIGFKSLKSLCLKGFNVSGEAIDSFQRYTHHRNWYLRISQKLVGADFDTRTRPAGAKHFARAARLQFLTLDLFYPDVFFANAFPQIPMLKNLAVKYSGAY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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