当前解析结果
SmilChr04G000769| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000769 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000769 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000769 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 9429957 - 9431777 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022960 |
|---|---|
| GeneID | 131022960 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022960 |
| 原始查询 | SmilChr04G000769 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022960 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808483.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808483.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057808483.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057808483.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808483.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:9429963 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B29 |
Chr4:9429976 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B3,C34 |
Chr4:9429980 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B3,C34 |
Chr4:9430004 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B34,B80,C85 |
Chr4:9430014 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B90 |
Chr4:9430098 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B114,B18 |
Chr4:9430131 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B87 |
Chr4:9430134 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B8,B93,C10 |
Chr4:9430164 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B106,B26,B31,B66,C39 |
Chr4:9430164 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B106,B26,B31,B66,C39 |
Chr4:9430223 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B106,B72 |
Chr4:9430238 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B19,B45,B5,B60 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。