当前解析结果
SmilChr04G000774| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000774 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000774 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000774 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 9494444 - 9496501 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022965 |
|---|---|
| GeneID | 131022965 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022965 |
| 原始查询 | SmilChr04G000774 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=27.7; qcov=0.2; evalue=7.91e-10; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022965 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808488.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808488.1 |
| 3 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057808488.1 |
| 4 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057808488.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.20000 | XP_057808488.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:9494474 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B60,B65 |
Chr4:9494484 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B51,B56,B87,C38,C40 |
Chr4:9494488 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B115,B133,B33 |
Chr4:9494496 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,B133,B20 |
Chr4:9494497 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,C44 |
Chr4:9494498 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr4:9494535 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,B60 |
Chr4:9494541 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B60 |
Chr4:9494541 |
T |
TC |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr4:9494555 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr4:9494575 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A15,B102,B121,B122,B136,B138,B139,B34,C28,C31,C37,C85 |
Chr4:9494622 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B36,B76,C20,C47 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。