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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000784`

染色体: Chr04 坐标: 9649775-9652324 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000784`
名称	SmilChr04G000784
描述	high mobility group B protein 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	9649775 - 9652324 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022633`
GeneID	`131022633`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022633`
原始查询	`SmilChr04G000784`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high mobility group B protein 1
产物	high mobility group B protein 1
Arabidopsis	`AT3G51880` (HMGB1) high mobility group B1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824351] identity=71.1; qcov=0.861; evalue=1.12e-58; confidence=high
Rice	`Os09g0551600` - identity=56.3; qcov=0.721; evalue=8.91e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00505 (HMG_box); PF09011 (HMG_box_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022633

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808124.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057808124.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057808124.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057808124.1`
5	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057808124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:9650967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808124.1

165 aa

165

HMG_box_2

HMG_box

PF09011 HMG_box_2 51-123 aa PF00505 HMG_box 54-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808124.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	51	123	6.2e-16	59.5	HMG-box domain
`XP_057808124.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	54	123	1.7e-24	86.7	HMG (high mobility group) box

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952141.1
CACCTCCAAACGGCTCGATCATCTGCGTTGCCGAATTAGTTACTGTCACTAAACGGGATTTTTTTACCCTAAATCTGTGGCTCTCATTACCAGCTAGCCCGGTACCCCGTTAAAGTAAGCGTTCTATCCCACTCGCTGGGGTCGTACTATATTCTCTGATCTCTCCTTTCATTGATACACTTCTCTCTATTGACCGATCACCGATCGCTTGTTATCTTCTAGATATGAAGACTGGTAGCAGGAGCAGAGGGGCTACGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022633
ATGAAGACTGGTAGCAGGAGCAGAGGGGCTACGAGAAAGGAAACTAAAGAAGCATTGAAGCCTGCTGAAGATAGGAGGGTAGGGAAGAGGAAGGCTGCCCCAAAGGTAGATACACGGAAGGGTAAGAAGGAAAAGAAGGCCATTAAAGATCCAAACAAGCCCAAGAGGCCCCCAAGCGCCTTCTTTGTCTTCCTTGAGGAATTCCGGAAGACCTTCAAAAAGGAAAATCCAAATGTCAAAGCCGTCTCAGCAGTTGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808124.1
MKTGSRSRGATRKETKEALKPAEDRRVGKRKAAPKVDTRKGKKEKKAIKDPNKPKRPPSAFFVFLEEFRKTFKKENPNVKAVSAVGKAGGERWKSLSEAEKAPYEAKAAKRKVEYEKLMNAYNKKQESSADEGDEGSEKSASEVHDDEESVQEEDEEEDDDEDDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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