当前解析结果
SmilChr04G000795| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000795 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000795 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000795 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 9827654 - 9829547 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022643 |
|---|---|
| GeneID | 131022643 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022643 |
| 原始查询 | SmilChr04G000795 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022643 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808138.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057808138.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057808138.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057808138.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808138.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:9827690 |
AAT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | B24,B33,B39,B55,B93,C12,C2,C20,C31,C71,C75,C78,D7 |
Chr4:9827693 |
G |
GCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 12 | B24,B33,B39,B55,B93,C12,C2,C20,C31,C71,C78,D7 |
Chr4:9827694 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B41,C39,C75,D10 |
Chr4:9827697 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 32 | A1,B102,B104,B107,B120,B126,B13,B130,B139,B17,B51,B52,B57,B62,B64,B65,B73,B75,B8,B84,C1,C14,C48,C53,C59,C70,C77,C83,C87,D11,D7,D8 |
Chr4:9827699 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B41,C39,C75 |
Chr4:9827716 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B11 |
Chr4:9827718 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr4:9827728 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr4:9827736 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 53 | A24,A25,A5,B101,B114,B117,B119,B129,B131,B135,B136,B15,B16,B21,B26,B28,B29,B37,B44,B46,B47,B56,B60,B71,B85,B88,B89,B9,B93,B95,B96,B97,C10,C26,C32,C35,C38,C39,C42,C43,C44,C46,C49,C51,C57,C62,C68,C70,C73,C76,C8,C80,D11 |
Chr4:9827767 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B35 |
Chr4:9827775 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B108,B27,B9,C43 |
Chr4:9827779 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。