当前解析结果
SmilChr04G000805| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000805 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000805 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000805 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 9956271 - 9957134 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022972 |
|---|---|
| GeneID | 131022972 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022972 |
| 原始查询 | SmilChr04G000805 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os09g0268600- identity=32.9; qcov=0.806; evalue=5.14e-17; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022972 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808495.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808495.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808495.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808495.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057808495.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:9956276 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B100,C10 |
Chr4:9956286 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,C68 |
Chr4:9956288 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 11 | B108,B125,B26,B43,B61,B77,B8,B80,C2,C35,C72 |
Chr4:9956292 |
ACG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B108,B125,B26,B43,B61,B77,B8,B80,C2,C35,C72 |
Chr4:9956323 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B10,B135,B49,B9,C37 |
Chr4:9956355 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B10,B135,B49,B9,C37 |
Chr4:9956355 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B10,B135,B49,B9,C37 |
Chr4:9956375 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B66,C79 |
Chr4:9956375 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B66,C79 |
Chr4:9956393 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B66,C79 |
Chr4:9956395 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B11 |
Chr4:9956413 |
ACG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A14,B102,B115,B119,B13,B42,B43,B95,C18,C32,C38,C43,C49,C5,C68,C74 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。