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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000810`

染色体: Chr04 坐标: 10128874-10130147 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000810`
名称	SmilChr04G000810
描述	rhodanese-like domain-containing protein 10
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10128874 - 10130147 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022652`
GeneID	`131022652`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022652`
原始查询	`SmilChr04G000810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like domain-containing protein 10
产物	rhodanese-like domain-containing protein 10
Arabidopsis	`AT3G08920` (AT3G08920) Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820041] identity=63.5; qcov=0.879; evalue=2.79e-82; confidence=high
Rice	`Os03g0289400` (OsStr2) - identity=61; qcov=0.823; evalue=1.21e-76; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF00581 (Rhodanese)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022652

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057808153.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057808153.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057808153.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057808153.1`
5	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057808153.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10129155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B47
`Chr4:10129520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B59
`Chr4:10129644`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr4:10129644`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr4:10129677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C39,C75
`Chr4:10129682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,D7,D8
`Chr4:10129707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C39,C75
`Chr4:10129867`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A18,B124,B16,B44,B82,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808153.1

215 aa

108

215

Rhodanese

PF00581 Rhodanese 52-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808153.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	52	173	1.3e-10	42.3	Rhodanese-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952170.1
ACTGCAAGCTCCAATAATTCTTGCAATTCTATATTTTATTTTTAAATATATCTAAAATTATTAGTAGTTAAAATAAAACACCAAACAATATTCTAAAAACTAATTTCACTAATGAGAAATAAAAGTATAAATCATTTTTCCTTCAATGGTTGGCCATTAAAAAAGGGTCTATCTCCAGAGGTGTGAGTGAAAAGATAAGGTGAGTGTAACTAAGGCTCAAAGCGACAGCATGGCACTTGATTTGAAGCACCACCACACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022652
ATGGCACTTGATTTGAAGCACCACCACACATCCGCCTTGAAACACCCGCGGTGCGCCGCCCCTCAGCCGCGGTCCGGCTCTCTGAGAGTGCATGCGGTGGTAGGCGGCAGAGCGCAGGAGCTGATAGAATCCGGTGCGGTGACCCCCATAGCACCAAAAGATGCAGCCGCGGCAATGGAGTCCCAAGGCTACAGATTGCTGGACATCAGGCCGCAGTGGGAGAGAGAGAAGGCACGCGTTTCGGGATCGATGCACGTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808153.1
MALDLKHHHTSALKHPRCAAPQPRSGSLRVHAVVGGRAQELIESGAVTPIAPKDAAAAMESQGYRLLDIRPQWEREKARVSGSMHVPLFVEDKDNSPITLLKKWVHLGYIGLWTGQLFTMINPTFLQQVEQAVPDKDSKLLVACGEGLRSLMAVAKLHKGGYKNLGWLAGGFTRATDDDFPAVEGSEKLEYATIGGASYYFLKLLLLIQAVGKKT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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