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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000812`

染色体: Chr04 坐标: 10189224-10192705 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000812`
名称	SmilChr04G000812
描述	wall-associated receptor kinase 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10189224 - 10192705 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022656`
GeneID	`131022656`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022656`
原始查询	`SmilChr04G000812`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	wall-associated receptor kinase 2-like
产物	wall-associated receptor kinase 2-like
Arabidopsis	`AT1G21270` (WAK2) wall-associated kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838723] identity=46; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0598900` (OsWAK50) - identity=44.1; qcov=0.88; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway); GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07645 (EGF_CA); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022656

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808157.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808157.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808157.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808157.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808157.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10189378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:10189621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B130,B35,B94,C74
`Chr4:10189648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:10189653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:10190063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C85
`Chr4:10190773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B58
`Chr4:10190780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr4:10191102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:10191227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:10191251`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B130,C74
`Chr4:10191251`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B130,C74
`Chr4:10191450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B135,B66,C58,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808157.1

789 aa

394

789

GUB_WAK_bind

EGF_CA

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF13947 GUB_WAK_bind 50-85 aa PF07645 EGF_CA 311-354 aa PF00069 Pkinase 440-706 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 443-710 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808157.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	50	85	3.3e-08	34.5	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057808157.1`	Pfam	`PF07645`	EGF_CA	Domain	311	354	3.5e-07	31.1	Calcium-binding EGF domain
`XP_057808157.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	440	706	7.6e-50	170.5	Protein kinase domain
`XP_057808157.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	443	710	1.8e-49	169.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952174.1
GCAGCATATATCATATTCATATCTACTCTCCAAACCAACCAACCTTAGTAATAATCCCAACCATGGCGCCGGAAAACATGCTCCTCGCCTGCCTCCTCCTCAGCAGCCTAACCCTTACACCACTCGCCGACACCAACTCCACCACCACCTCCGCCACCGTGGACACACACAACATCTCGAAGCCGCCCGCCACCATCTCCAAGCCCGGCTGCCCCAGCAAATGCGGCAACCTCACCGTCCCCTTCCCCTTCGGCGTCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022656
ATGGCGCCGGAAAACATGCTCCTCGCCTGCCTCCTCCTCAGCAGCCTAACCCTTACACCACTCGCCGACACCAACTCCACCACCACCTCCGCCACCGTGGACACACACAACATCTCGAAGCCGCCCGCCACCATCTCCAAGCCCGGCTGCCCCAGCAAATGCGGCAACCTCACCGTCCCCTTCCCCTTCGGCGTCGGCGTCGACTCCGGCTGCGCAATCAACTCCGACTTCGAGCTCAACTGCACCGACGCCTTCGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808157.1
MAPENMLLACLLLSSLTLTPLADTNSTTTSATVDTHNISKPPATISKPGCPSKCGNLTVPFPFGVGVDSGCAINSDFELNCTDAFGAPQALNGNIQFFDISDDRARISNVVARRCYDRAGSLTSDNAASSDITGTPYSYSPLNKFTVIGCDDFALVNGGGSRNFTSGCVTLCSRADDVINGSCSGIGCCQTSLPKGLQYYRADLSSLNNHTNVSSFDPCSYAFFGEEKRFEFLGAADLSDPNFVQRVRETVPIVVDWAIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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