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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000813`

染色体: Chr04 坐标: 10194500-10202649 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000813`
名称	SmilChr04G000813
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10194500 - 10202649 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022657`
GeneID	`131022657`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022657`
原始查询	`SmilChr04G000813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=27.9; qcov=0.552; evalue=6.4e-46; confidence=low
Rice	`Os10g0136100` - identity=27.4; qcov=0.639; evalue=7.51e-47; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022657

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057808158.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808158.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808158.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808158.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10199270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B115,B23,B48
`Chr4:10199335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B87,C78,D9
`Chr4:10199437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B113,C11,C69,C73
`Chr4:10199751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:10199878`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B24
`Chr4:10199878`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B24
`Chr4:10199924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:10199936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B23
`Chr4:10200085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C78
`Chr4:10200157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B131,B96,B99,C18
`Chr4:10200167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:10200173`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A15,A5,B108,B127,B13,B131,B139,B21,B29,B33,B45,B49,B53,B62,B67,B76,B78,B85,B91,B96,B97,B99,C17,C18,C34,C38,C40,C54,C6,C65,C76,C85,C9,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808158.1

1113 aa

556

1113

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 145-307 aa PF00931 NB-ARC 410-562 aa PF23559 WHD_DRP 645-712 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808158.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	145	307	9.5e-58	195.3	NB-ARC domain
`XP_057808158.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	410	562	9.5e-58	195.3	NB-ARC domain
`XP_057808158.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	645	712	1.2e-11	45.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101371.1
AAACGAAACGACCGAAACCGTGGGAATCAAAGTGATGGCAATTGAGTTTGACTCCATTTTTGACTCCAGCTTCCCATCCCTCTCCATCGTCGCCACTACACAGTGACAGTGTGTGTTTGAGAGATGGCTTATGCTGCTTTGCTTCCTCTTAAGCAATCGCTACACGCCCTTCTTAGTTCTGGTGCCATTTCCCCTTTTCAAACCGTACAATTGCTGGAAACGGCTCACGACGCCGTGAGGTCATTACAACGAGTTCTGGA...

XR_009101370.1
AAACGAAACGACCGAAACCGTGGGAATCAAAGTGATGGCAATTGAGTTTGACTCCATTTTTGACTCCAGCTTCCCATCCCTCTCCATCGTCGCCACTACACAGTGACAGTGTGTGTTTGAGAGATGGCTTATGCTGCTTTGCTTCCTCTTAAGCAATCGCTACACGCCCTTCTTAGTTCTGGTGCCATTTCCCCTTTTCAAACCGTACAATTGCTGGAAACGGCTCACGACGCCGTGAGGTCATTACAACGAGTTCTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022657
ATGGCTTATGCTGCTTTGCTTCCTCTTAAGCAATCGCTACACGCCCTTCTTAGTTCTGGTGCCATTTCCCCTTTTCAAACCGTACAATTGCTGGAAACGGCTCACGACGCCGTGAGGTCATTACAACGAGTTCTGGAAAAATCGGACGACACCGCCGGCAGCAAGAGGCTGGATGCTTTGGAGGGACGAATCCGAGATGAAGCACATAAATTCGATGATGTTTTGGAGTTCTCAGATACAATTCTCTCATCCCATGGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808158.1
MAYAALLPLKQSLHALLSSGAISPFQTVQLLETAHDAVRSLQRVLEKSDDTAGSKRLDALEGRIRDEAHKFDDVLEFSDTILSSHGSIEEIESFIATVKKLEGEYVKELDTPSLSEEAAASTTDFSAKMVGLSHEFAEIKAEVLSRMRPDDFGVFSIVGAGGGTGRTGVAKQVFDDLCVANEEAFDCGGWARVGPNYGCKDILLSIVAQVDPAIHEFLVMEGEDEVAEYLHTTLMGRRYMIVLDDICSIEAWGSLKRSFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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