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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000816`

染色体: Chr04 坐标: 10245368-10255591 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000816`
名称	SmilChr04G000816
描述	wall-associated receptor kinase 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10245368 - 10255591 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022659`
GeneID	`131022659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022659`
原始查询	`SmilChr04G000816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	wall-associated receptor kinase 2-like
产物	wall-associated receptor kinase 2-like
Arabidopsis	`AT1G21270` (WAK2) wall-associated kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838723] identity=46; qcov=0.941; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0598900` (OsWAK50) - identity=44.8; qcov=0.968; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway); GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07645 (EGF_CA); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808161.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808161.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808161.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808161.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808161.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10245548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B126,C17
`Chr4:10245561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:10245562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:10245576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B110,B27,C15
`Chr4:10245619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:10245630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:10245681`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C43
`Chr4:10245681`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr4:10245684`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C43
`Chr4:10245684`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C43
`Chr4:10245690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:10245698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808161.1

683 aa

342

683

GUB_WAK_bind

EGF_CA

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF13947 GUB_WAK_bind 47-81 aa PF07645 EGF_CA 308-346 aa PF00069 Pkinase 437-646 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 441-640 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808161.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	47	81	2e-09	38.4	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057808161.1`	Pfam	`PF07645`	EGF_CA	Domain	308	346	2.2e-10	41.3	Calcium-binding EGF domain
`XP_057808161.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	437	646	6.1e-45	154.4	Protein kinase domain
`XP_057808161.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	441	640	1.4e-44	153.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952178.1
CGCAATTAATCATCTATATTGATCAGCTGCAGACTTATTAGCAAAACACCCAACCTTTACCAGTTATAATCTCAACCATGCCGGAAACCATGCATCCACTCCTCCTCCTCCTCACCCTAACCCTAACCCTAACAACCGTACTCGCCGCCACCAACTCCACCGCCGCCGCGGACACACACCGCATCTCAAAAGCCGCCACCATCACCAAGCCCGGCTGCCCCGACAAATGCGGCAACCTCACCGTCCCCTTCCCCTTCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022659
ATGCCGGAAACCATGCATCCACTCCTCCTCCTCCTCACCCTAACCCTAACCCTAACAACCGTACTCGCCGCCACCAACTCCACCGCCGCCGCGGACACACACCGCATCTCAAAAGCCGCCACCATCACCAAGCCCGGCTGCCCCGACAAATGCGGCAACCTCACCGTCCCCTTCCCCTTCGGCATCGGCGCCGACTCCGGCTGCGCCCTCAACCCCGACTTCGAGCTCAACTGCACCGAAGCCTTCGGCGCGCCGCAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808161.1
MPETMHPLLLLLTLTLTLTTVLAATNSTAAADTHRISKAATITKPGCPDKCGNLTVPFPFGIGADSGCALNPDFELNCTEAFGAPQALNGNTQFFDISDDHCRVSIAVARKCYDRSGSPTLENTASFDIKAPPYSYSTLNKFTVIGCDDFSLISGGGGRNFTIGCITFCFRAEDVISGSCSGIGCCQTALPRGFQYYTTAVNSLNNHTNISSFATCSYAFFGEEDRFEFRGAADLSDPNFMQRVKDTVPVVLDWVIGNLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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